Protein–RNA interactions for Protein: P34968

Htr2c, 5-hydroxytryptamine receptor 2C, mousemouse

Predictions only

Length 459 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Htr2cP34968 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Htr2cP34968 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Htr2cP34968 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Htr2cP34968 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Htr2cP34968 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Htr2cP34968 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Htr2cP34968 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Htr2cP34968 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Htr2cP34968 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Htr2cP34968 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Htr2cP34968 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Htr2cP34968 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Htr2cP34968 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Htr2cP34968 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Htr2cP34968 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Htr2cP34968 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Htr2cP34968 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Htr2cP34968 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Htr2cP34968 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Htr2cP34968 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Htr2cP34968 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Htr2cP34968 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Htr2cP34968 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Htr2cP34968 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Htr2cP34968 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Htr2cP34968 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Htr2cP34968 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Htr2cP34968 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Htr2cP34968 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Htr2cP34968 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Htr2cP34968 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Htr2cP34968 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Htr2cP34968 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Htr2cP34968 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Htr2cP34968 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Htr2cP34968 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Htr2cP34968 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Htr2cP34968 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Htr2cP34968 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Htr2cP34968 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Htr2cP34968 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Htr2cP34968 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Htr2cP34968 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Htr2cP34968 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Htr2cP34968 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Htr2cP34968 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Htr2cP34968 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Htr2cP34968 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Htr2cP34968 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Htr2cP34968 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Htr2cP34968 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Htr2cP34968 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Htr2cP34968 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Htr2cP34968 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Htr2cP34968 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Htr2cP34968 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Htr2cP34968 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Htr2cP34968 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Htr2cP34968 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Htr2cP34968 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Htr2cP34968 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Htr2cP34968 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Htr2cP34968 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Htr2cP34968 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Htr2cP34968 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Htr2cP34968 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Htr2cP34968 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Htr2cP34968 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Htr2cP34968 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Htr2cP34968 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Htr2cP34968 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Htr2cP34968 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Htr2cP34968 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Htr2cP34968 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Htr2cP34968 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Htr2cP34968 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Htr2cP34968 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Htr2cP34968 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Htr2cP34968 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Htr2cP34968 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Htr2cP34968 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Htr2cP34968 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Htr2cP34968 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Htr2cP34968 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Htr2cP34968 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Htr2cP34968 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Htr2cP34968 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Htr2cP34968 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Htr2cP34968 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Htr2cP34968 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Htr2cP34968 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Htr2cP34968 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Htr2cP34968 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Htr2cP34968 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Htr2cP34968 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Htr2cP34968 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Htr2cP34968 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Htr2cP34968 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Htr2cP34968 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Htr2cP34968 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms