Protein–RNA interactions for Protein: P33435

Mmp13, Collagenase 3, mousemouse

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp13P33435 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Mmp13P33435 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Mmp13P33435 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Mmp13P33435 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Mmp13P33435 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Mmp13P33435 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Mmp13P33435 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Mmp13P33435 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Mmp13P33435 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Mmp13P33435 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Mmp13P33435 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Mmp13P33435 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Mmp13P33435 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Mmp13P33435 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Mmp13P33435 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Mmp13P33435 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Mmp13P33435 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Mmp13P33435 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Mmp13P33435 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Mmp13P33435 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Mmp13P33435 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Mmp13P33435 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Mmp13P33435 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Mmp13P33435 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Mmp13P33435 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Mmp13P33435 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Mmp13P33435 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Mmp13P33435 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Mmp13P33435 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Mmp13P33435 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Mmp13P33435 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Mmp13P33435 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Mmp13P33435 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Mmp13P33435 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Mmp13P33435 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Mmp13P33435 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Mmp13P33435 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Mmp13P33435 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Mmp13P33435 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Mmp13P33435 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Mmp13P33435 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Mmp13P33435 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Mmp13P33435 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Mmp13P33435 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Mmp13P33435 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Mmp13P33435 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Mmp13P33435 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Mmp13P33435 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Mmp13P33435 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Mmp13P33435 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Mmp13P33435 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Mmp13P33435 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Mmp13P33435 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Mmp13P33435 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Mmp13P33435 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Mmp13P33435 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Mmp13P33435 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Mmp13P33435 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Mmp13P33435 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Mmp13P33435 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Mmp13P33435 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Mmp13P33435 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Mmp13P33435 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Mmp13P33435 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Mmp13P33435 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Mmp13P33435 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Mmp13P33435 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Mmp13P33435 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Mmp13P33435 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Mmp13P33435 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Mmp13P33435 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Mmp13P33435 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Mmp13P33435 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Mmp13P33435 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Mmp13P33435 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Mmp13P33435 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Mmp13P33435 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Mmp13P33435 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Mmp13P33435 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Mmp13P33435 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Mmp13P33435 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Mmp13P33435 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Mmp13P33435 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Mmp13P33435 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Mmp13P33435 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Mmp13P33435 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Mmp13P33435 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Mmp13P33435 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Mmp13P33435 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Mmp13P33435 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Mmp13P33435 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Mmp13P33435 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Mmp13P33435 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Mmp13P33435 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Mmp13P33435 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Mmp13P33435 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Mmp13P33435 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Mmp13P33435 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Mmp13P33435 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Mmp13P33435 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms