Protein–RNA interactions for Protein: P32043

Hoxc5, Homeobox protein Hox-C5, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc5P32043 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Hoxc5P32043 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Hoxc5P32043 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Hoxc5P32043 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Hoxc5P32043 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Hoxc5P32043 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Hoxc5P32043 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Hoxc5P32043 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Hoxc5P32043 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Hoxc5P32043 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Hoxc5P32043 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Hoxc5P32043 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Hoxc5P32043 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Hoxc5P32043 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Hoxc5P32043 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Hoxc5P32043 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Hoxc5P32043 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Hoxc5P32043 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Hoxc5P32043 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Hoxc5P32043 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Hoxc5P32043 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Hoxc5P32043 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Hoxc5P32043 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Hoxc5P32043 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Hoxc5P32043 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Hoxc5P32043 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Hoxc5P32043 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Hoxc5P32043 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Hoxc5P32043 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Hoxc5P32043 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Hoxc5P32043 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Hoxc5P32043 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Hoxc5P32043 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Hoxc5P32043 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Hoxc5P32043 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Hoxc5P32043 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Hoxc5P32043 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Hoxc5P32043 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Hoxc5P32043 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Hoxc5P32043 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Hoxc5P32043 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Hoxc5P32043 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Hoxc5P32043 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Hoxc5P32043 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Hoxc5P32043 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hoxc5P32043 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hoxc5P32043 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hoxc5P32043 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hoxc5P32043 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hoxc5P32043 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Hoxc5P32043 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hoxc5P32043 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hoxc5P32043 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hoxc5P32043 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Hoxc5P32043 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hoxc5P32043 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hoxc5P32043 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hoxc5P32043 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hoxc5P32043 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hoxc5P32043 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hoxc5P32043 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hoxc5P32043 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hoxc5P32043 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hoxc5P32043 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hoxc5P32043 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hoxc5P32043 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hoxc5P32043 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hoxc5P32043 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hoxc5P32043 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hoxc5P32043 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hoxc5P32043 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hoxc5P32043 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Hoxc5P32043 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hoxc5P32043 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hoxc5P32043 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hoxc5P32043 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hoxc5P32043 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hoxc5P32043 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hoxc5P32043 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Hoxc5P32043 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hoxc5P32043 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hoxc5P32043 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hoxc5P32043 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hoxc5P32043 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hoxc5P32043 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hoxc5P32043 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hoxc5P32043 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hoxc5P32043 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Hoxc5P32043 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Hoxc5P32043 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hoxc5P32043 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hoxc5P32043 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hoxc5P32043 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hoxc5P32043 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hoxc5P32043 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hoxc5P32043 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hoxc5P32043 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hoxc5P32043 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hoxc5P32043 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hoxc5P32043 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.7 ms