Protein–RNA interactions for Protein: P31001

Des, Desmin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DesP31001 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DesP31001 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DesP31001 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DesP31001 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DesP31001 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DesP31001 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DesP31001 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
DesP31001 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DesP31001 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DesP31001 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
DesP31001 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DesP31001 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
DesP31001 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DesP31001 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
DesP31001 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DesP31001 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
DesP31001 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
DesP31001 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
DesP31001 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
DesP31001 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
DesP31001 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
DesP31001 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
DesP31001 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
DesP31001 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
DesP31001 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
DesP31001 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
DesP31001 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
DesP31001 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
DesP31001 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DesP31001 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
DesP31001 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DesP31001 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DesP31001 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DesP31001 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DesP31001 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DesP31001 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DesP31001 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DesP31001 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
DesP31001 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DesP31001 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DesP31001 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DesP31001 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DesP31001 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DesP31001 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
DesP31001 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DesP31001 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DesP31001 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DesP31001 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DesP31001 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DesP31001 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DesP31001 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DesP31001 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
DesP31001 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DesP31001 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DesP31001 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DesP31001 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DesP31001 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DesP31001 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DesP31001 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DesP31001 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
DesP31001 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
DesP31001 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
DesP31001 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
DesP31001 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
DesP31001 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
DesP31001 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
DesP31001 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
DesP31001 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
DesP31001 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
DesP31001 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
DesP31001 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
DesP31001 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
DesP31001 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DesP31001 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DesP31001 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DesP31001 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DesP31001 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DesP31001 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DesP31001 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DesP31001 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DesP31001 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DesP31001 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DesP31001 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DesP31001 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DesP31001 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DesP31001 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DesP31001 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DesP31001 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DesP31001 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DesP31001 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DesP31001 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DesP31001 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DesP31001 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DesP31001 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DesP31001 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DesP31001 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DesP31001 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DesP31001 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DesP31001 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DesP31001 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms