Protein–RNA interactions for Protein: P28271

Aco1, Cytoplasmic aconitate hydratase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 889 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aco1P28271 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Aco1P28271 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Aco1P28271 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Aco1P28271 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Aco1P28271 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Aco1P28271 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Aco1P28271 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Aco1P28271 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Aco1P28271 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Aco1P28271 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Aco1P28271 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Aco1P28271 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Aco1P28271 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Aco1P28271 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Aco1P28271 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Aco1P28271 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Aco1P28271 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Aco1P28271 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Aco1P28271 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Aco1P28271 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Aco1P28271 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Aco1P28271 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Aco1P28271 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Aco1P28271 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Aco1P28271 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Aco1P28271 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Aco1P28271 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Aco1P28271 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Aco1P28271 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Aco1P28271 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Aco1P28271 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Aco1P28271 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Aco1P28271 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Aco1P28271 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Aco1P28271 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Aco1P28271 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Aco1P28271 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Aco1P28271 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Aco1P28271 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Aco1P28271 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Aco1P28271 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Aco1P28271 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Aco1P28271 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Aco1P28271 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Aco1P28271 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Aco1P28271 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Aco1P28271 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Aco1P28271 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Aco1P28271 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Aco1P28271 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Aco1P28271 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Aco1P28271 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Aco1P28271 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Aco1P28271 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Aco1P28271 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Aco1P28271 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Aco1P28271 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
Aco1P28271 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
Aco1P28271 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Aco1P28271 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Aco1P28271 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Aco1P28271 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Aco1P28271 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Aco1P28271 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Aco1P28271 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Aco1P28271 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Aco1P28271 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Aco1P28271 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Aco1P28271 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Aco1P28271 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Aco1P28271 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Aco1P28271 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Aco1P28271 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Aco1P28271 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Aco1P28271 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Aco1P28271 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Aco1P28271 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Aco1P28271 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Aco1P28271 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Aco1P28271 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Aco1P28271 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Aco1P28271 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Aco1P28271 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Aco1P28271 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Aco1P28271 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Aco1P28271 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Aco1P28271 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Aco1P28271 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Aco1P28271 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Aco1P28271 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Aco1P28271 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Aco1P28271 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Aco1P28271 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Aco1P28271 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Aco1P28271 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Aco1P28271 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Aco1P28271 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Aco1P28271 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Aco1P28271 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Aco1P28271 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms