Protein–RNA interactions for Protein: P28236

Gja8, Gap junction alpha-8 protein, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja8P28236 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Gja8P28236 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Gja8P28236 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Gja8P28236 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Gja8P28236 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Gja8P28236 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Gja8P28236 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Gja8P28236 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Gja8P28236 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Gja8P28236 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Gja8P28236 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Gja8P28236 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Gja8P28236 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Gja8P28236 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Gja8P28236 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Gja8P28236 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Gja8P28236 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Gja8P28236 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Gja8P28236 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Gja8P28236 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Gja8P28236 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Gja8P28236 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Gja8P28236 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Gja8P28236 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Gja8P28236 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Gja8P28236 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Gja8P28236 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Gja8P28236 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Gja8P28236 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Gja8P28236 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Gja8P28236 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Gja8P28236 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Gja8P28236 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Gja8P28236 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Gja8P28236 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Gja8P28236 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Gja8P28236 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Gja8P28236 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Gja8P28236 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Gja8P28236 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Gja8P28236 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Gja8P28236 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Gja8P28236 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Gja8P28236 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Gja8P28236 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Gja8P28236 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gja8P28236 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gja8P28236 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gja8P28236 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Gja8P28236 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gja8P28236 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gja8P28236 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Gja8P28236 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Gja8P28236 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Gja8P28236 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Gja8P28236 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Gja8P28236 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gja8P28236 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gja8P28236 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gja8P28236 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gja8P28236 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gja8P28236 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Gja8P28236 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Gja8P28236 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gja8P28236 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Gja8P28236 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Gja8P28236 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Gja8P28236 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Gja8P28236 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Gja8P28236 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Gja8P28236 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Gja8P28236 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Gja8P28236 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Gja8P28236 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Gja8P28236 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gja8P28236 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gja8P28236 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Gja8P28236 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gja8P28236 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gja8P28236 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gja8P28236 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gja8P28236 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Gja8P28236 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gja8P28236 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gja8P28236 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gja8P28236 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gja8P28236 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gja8P28236 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gja8P28236 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gja8P28236 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gja8P28236 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gja8P28236 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Gja8P28236 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Gja8P28236 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Gja8P28236 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Gja8P28236 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Gja8P28236 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Gja8P28236 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gja8P28236 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gja8P28236 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 1512 ms