Protein–RNA interactions for Protein: P28229

Gjc1, Gap junction gamma-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjc1P28229 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Gjc1P28229 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gjc1P28229 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gjc1P28229 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gjc1P28229 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Gjc1P28229 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gjc1P28229 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gjc1P28229 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gjc1P28229 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gjc1P28229 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gjc1P28229 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gjc1P28229 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Gjc1P28229 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gjc1P28229 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gjc1P28229 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gjc1P28229 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gjc1P28229 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gjc1P28229 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gjc1P28229 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gjc1P28229 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gjc1P28229 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Gjc1P28229 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gjc1P28229 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gjc1P28229 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gjc1P28229 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gjc1P28229 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gjc1P28229 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gjc1P28229 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gjc1P28229 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gjc1P28229 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Gjc1P28229 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gjc1P28229 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gjc1P28229 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gjc1P28229 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gjc1P28229 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gjc1P28229 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gjc1P28229 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gjc1P28229 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gjc1P28229 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gjc1P28229 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Gjc1P28229 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gjc1P28229 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gjc1P28229 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gjc1P28229 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Gjc1P28229 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Gjc1P28229 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Gjc1P28229 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Gjc1P28229 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Gjc1P28229 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Gjc1P28229 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Gjc1P28229 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gjc1P28229 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gjc1P28229 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gjc1P28229 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gjc1P28229 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gjc1P28229 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Gjc1P28229 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gjc1P28229 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Gjc1P28229 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gjc1P28229 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gjc1P28229 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gjc1P28229 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gjc1P28229 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gjc1P28229 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gjc1P28229 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gjc1P28229 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gjc1P28229 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gjc1P28229 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gjc1P28229 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gjc1P28229 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gjc1P28229 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gjc1P28229 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gjc1P28229 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gjc1P28229 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gjc1P28229 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Gjc1P28229 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gjc1P28229 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gjc1P28229 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gjc1P28229 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gjc1P28229 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Gjc1P28229 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gjc1P28229 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gjc1P28229 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gjc1P28229 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gjc1P28229 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gjc1P28229 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gjc1P28229 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gjc1P28229 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gjc1P28229 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gjc1P28229 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gjc1P28229 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gjc1P28229 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gjc1P28229 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gjc1P28229 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gjc1P28229 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gjc1P28229 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Gjc1P28229 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gjc1P28229 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gjc1P28229 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Gjc1P28229 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48 ms