Protein–RNA interactions for Protein: P27782

Lef1, Lymphoid enhancer-binding factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 397 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lef1P27782 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lef1P27782 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lef1P27782 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lef1P27782 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lef1P27782 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lef1P27782 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lef1P27782 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lef1P27782 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lef1P27782 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lef1P27782 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Lef1P27782 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lef1P27782 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lef1P27782 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lef1P27782 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lef1P27782 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lef1P27782 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lef1P27782 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lef1P27782 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lef1P27782 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lef1P27782 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lef1P27782 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lef1P27782 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lef1P27782 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lef1P27782 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lef1P27782 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lef1P27782 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lef1P27782 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lef1P27782 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lef1P27782 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lef1P27782 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lef1P27782 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lef1P27782 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lef1P27782 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lef1P27782 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lef1P27782 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lef1P27782 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Lef1P27782 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lef1P27782 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lef1P27782 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lef1P27782 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lef1P27782 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lef1P27782 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lef1P27782 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lef1P27782 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lef1P27782 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lef1P27782 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lef1P27782 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lef1P27782 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lef1P27782 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lef1P27782 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lef1P27782 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lef1P27782 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lef1P27782 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lef1P27782 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lef1P27782 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lef1P27782 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lef1P27782 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lef1P27782 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lef1P27782 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lef1P27782 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lef1P27782 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lef1P27782 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lef1P27782 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lef1P27782 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lef1P27782 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lef1P27782 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lef1P27782 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Lef1P27782 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lef1P27782 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Lef1P27782 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lef1P27782 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lef1P27782 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lef1P27782 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lef1P27782 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lef1P27782 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lef1P27782 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lef1P27782 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lef1P27782 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lef1P27782 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lef1P27782 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lef1P27782 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Lef1P27782 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Lef1P27782 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lef1P27782 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lef1P27782 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lef1P27782 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lef1P27782 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lef1P27782 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lef1P27782 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lef1P27782 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lef1P27782 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lef1P27782 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lef1P27782 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lef1P27782 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lef1P27782 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lef1P27782 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lef1P27782 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lef1P27782 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lef1P27782 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lef1P27782 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms