Protein–RNA interactions for Protein: P23242

Gja1, Gap junction alpha-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja1P23242 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gja1P23242 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gja1P23242 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gja1P23242 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gja1P23242 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gja1P23242 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Gja1P23242 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gja1P23242 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gja1P23242 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gja1P23242 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gja1P23242 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gja1P23242 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gja1P23242 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Gja1P23242 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gja1P23242 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gja1P23242 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gja1P23242 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gja1P23242 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gja1P23242 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gja1P23242 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gja1P23242 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Gja1P23242 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Gja1P23242 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gja1P23242 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gja1P23242 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Gja1P23242 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gja1P23242 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gja1P23242 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gja1P23242 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gja1P23242 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gja1P23242 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gja1P23242 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gja1P23242 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gja1P23242 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Gja1P23242 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gja1P23242 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gja1P23242 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gja1P23242 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Gja1P23242 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gja1P23242 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gja1P23242 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gja1P23242 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gja1P23242 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gja1P23242 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gja1P23242 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gja1P23242 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gja1P23242 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Gja1P23242 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gja1P23242 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gja1P23242 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gja1P23242 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gja1P23242 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gja1P23242 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gja1P23242 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gja1P23242 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gja1P23242 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gja1P23242 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gja1P23242 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gja1P23242 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gja1P23242 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gja1P23242 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gja1P23242 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gja1P23242 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gja1P23242 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gja1P23242 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gja1P23242 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gja1P23242 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Gja1P23242 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Gja1P23242 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Gja1P23242 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gja1P23242 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gja1P23242 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gja1P23242 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gja1P23242 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gja1P23242 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gja1P23242 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gja1P23242 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Gja1P23242 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gja1P23242 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gja1P23242 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gja1P23242 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gja1P23242 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gja1P23242 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gja1P23242 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gja1P23242 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gja1P23242 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gja1P23242 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gja1P23242 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gja1P23242 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gja1P23242 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gja1P23242 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gja1P23242 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gja1P23242 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gja1P23242 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Gja1P23242 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gja1P23242 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gja1P23242 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gja1P23242 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gja1P23242 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gja1P23242 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.8 ms