Protein–RNA interactions for Protein: P23204

Ppara, Peroxisome proliferator-activated receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PparaP23204 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PparaP23204 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PparaP23204 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PparaP23204 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PparaP23204 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PparaP23204 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PparaP23204 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PparaP23204 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PparaP23204 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.56
PparaP23204 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PparaP23204 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PparaP23204 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PparaP23204 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PparaP23204 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PparaP23204 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PparaP23204 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PparaP23204 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PparaP23204 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PparaP23204 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PparaP23204 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PparaP23204 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PparaP23204 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PparaP23204 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PparaP23204 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PparaP23204 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PparaP23204 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PparaP23204 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PparaP23204 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PparaP23204 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PparaP23204 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PparaP23204 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PparaP23204 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
PparaP23204 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PparaP23204 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PparaP23204 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PparaP23204 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PparaP23204 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
PparaP23204 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
PparaP23204 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PparaP23204 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PparaP23204 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PparaP23204 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PparaP23204 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PparaP23204 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PparaP23204 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PparaP23204 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PparaP23204 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PparaP23204 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PparaP23204 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PparaP23204 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PparaP23204 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PparaP23204 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PparaP23204 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PparaP23204 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PparaP23204 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PparaP23204 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PparaP23204 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
PparaP23204 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PparaP23204 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PparaP23204 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PparaP23204 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PparaP23204 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
PparaP23204 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PparaP23204 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PparaP23204 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PparaP23204 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PparaP23204 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PparaP23204 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PparaP23204 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PparaP23204 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PparaP23204 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PparaP23204 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PparaP23204 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PparaP23204 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PparaP23204 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
PparaP23204 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PparaP23204 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PparaP23204 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PparaP23204 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PparaP23204 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PparaP23204 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PparaP23204 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PparaP23204 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PparaP23204 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PparaP23204 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PparaP23204 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
PparaP23204 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PparaP23204 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PparaP23204 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PparaP23204 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PparaP23204 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PparaP23204 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PparaP23204 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PparaP23204 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PparaP23204 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PparaP23204 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PparaP23204 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PparaP23204 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PparaP23204 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PparaP23204 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms