Protein–RNA interactions for Protein: P20490

Ms4a2, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a2P20490 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ms4a2P20490 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ms4a2P20490 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ms4a2P20490 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ms4a2P20490 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ms4a2P20490 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ms4a2P20490 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ms4a2P20490 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ms4a2P20490 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ms4a2P20490 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ms4a2P20490 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ms4a2P20490 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ms4a2P20490 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ms4a2P20490 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ms4a2P20490 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ms4a2P20490 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ms4a2P20490 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ms4a2P20490 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ms4a2P20490 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ms4a2P20490 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ms4a2P20490 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ms4a2P20490 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ms4a2P20490 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ms4a2P20490 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ms4a2P20490 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ms4a2P20490 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ms4a2P20490 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ms4a2P20490 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ms4a2P20490 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Ms4a2P20490 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ms4a2P20490 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ms4a2P20490 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ms4a2P20490 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Ms4a2P20490 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ms4a2P20490 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ms4a2P20490 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ms4a2P20490 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Ms4a2P20490 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ms4a2P20490 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ms4a2P20490 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Ms4a2P20490 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ms4a2P20490 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ms4a2P20490 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ms4a2P20490 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ms4a2P20490 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.76
Ms4a2P20490 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ms4a2P20490 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ms4a2P20490 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ms4a2P20490 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ms4a2P20490 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ms4a2P20490 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ms4a2P20490 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ms4a2P20490 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ms4a2P20490 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ms4a2P20490 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ms4a2P20490 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ms4a2P20490 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ms4a2P20490 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ms4a2P20490 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ms4a2P20490 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ms4a2P20490 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Ms4a2P20490 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ms4a2P20490 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ms4a2P20490 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ms4a2P20490 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ms4a2P20490 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ms4a2P20490 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ms4a2P20490 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ms4a2P20490 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ms4a2P20490 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ms4a2P20490 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ms4a2P20490 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ms4a2P20490 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Ms4a2P20490 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Ms4a2P20490 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ms4a2P20490 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ms4a2P20490 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ms4a2P20490 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Ms4a2P20490 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Ms4a2P20490 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ms4a2P20490 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ms4a2P20490 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ms4a2P20490 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ms4a2P20490 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ms4a2P20490 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ms4a2P20490 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ms4a2P20490 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ms4a2P20490 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ms4a2P20490 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ms4a2P20490 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ms4a2P20490 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ms4a2P20490 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ms4a2P20490 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ms4a2P20490 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ms4a2P20490 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ms4a2P20490 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ms4a2P20490 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ms4a2P20490 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ms4a2P20490 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ms4a2P20490 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms