Protein–RNA interactions for Protein: P20152

Vim, Vimentin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VimP20152 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
VimP20152 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
VimP20152 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
VimP20152 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
VimP20152 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
VimP20152 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
VimP20152 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
VimP20152 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
VimP20152 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
VimP20152 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
VimP20152 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
VimP20152 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
VimP20152 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
VimP20152 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
VimP20152 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
VimP20152 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
VimP20152 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
VimP20152 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
VimP20152 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
VimP20152 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
VimP20152 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
VimP20152 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
VimP20152 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
VimP20152 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
VimP20152 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
VimP20152 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
VimP20152 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
VimP20152 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
VimP20152 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
VimP20152 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
VimP20152 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
VimP20152 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
VimP20152 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
VimP20152 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
VimP20152 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
VimP20152 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
VimP20152 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
VimP20152 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
VimP20152 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
VimP20152 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
VimP20152 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
VimP20152 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
VimP20152 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
VimP20152 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
VimP20152 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
VimP20152 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
VimP20152 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
VimP20152 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
VimP20152 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
VimP20152 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
VimP20152 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
VimP20152 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
VimP20152 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
VimP20152 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
VimP20152 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
VimP20152 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
VimP20152 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
VimP20152 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
VimP20152 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
VimP20152 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
VimP20152 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
VimP20152 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
VimP20152 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
VimP20152 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
VimP20152 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
VimP20152 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
VimP20152 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
VimP20152 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
VimP20152 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
VimP20152 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
VimP20152 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
VimP20152 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
VimP20152 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
VimP20152 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
VimP20152 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
VimP20152 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
VimP20152 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
VimP20152 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
VimP20152 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
VimP20152 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
VimP20152 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
VimP20152 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
VimP20152 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
VimP20152 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
VimP20152 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
VimP20152 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
VimP20152 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
VimP20152 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
VimP20152 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
VimP20152 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
VimP20152 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
VimP20152 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
VimP20152 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
VimP20152 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
VimP20152 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
VimP20152 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
VimP20152 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
VimP20152 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
VimP20152 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
VimP20152 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms