Protein–RNA interactions for Protein: P20033

Pdgfa, Platelet-derived growth factor subunit A, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfaP20033 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
PdgfaP20033 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
PdgfaP20033 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PdgfaP20033 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PdgfaP20033 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
PdgfaP20033 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PdgfaP20033 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
PdgfaP20033 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
PdgfaP20033 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
PdgfaP20033 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PdgfaP20033 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PdgfaP20033 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PdgfaP20033 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PdgfaP20033 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PdgfaP20033 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PdgfaP20033 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
PdgfaP20033 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PdgfaP20033 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PdgfaP20033 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PdgfaP20033 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PdgfaP20033 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PdgfaP20033 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PdgfaP20033 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PdgfaP20033 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PdgfaP20033 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
PdgfaP20033 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PdgfaP20033 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
PdgfaP20033 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PdgfaP20033 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PdgfaP20033 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PdgfaP20033 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PdgfaP20033 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PdgfaP20033 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PdgfaP20033 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PdgfaP20033 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PdgfaP20033 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PdgfaP20033 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PdgfaP20033 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PdgfaP20033 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PdgfaP20033 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PdgfaP20033 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PdgfaP20033 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PdgfaP20033 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PdgfaP20033 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PdgfaP20033 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PdgfaP20033 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PdgfaP20033 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PdgfaP20033 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PdgfaP20033 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PdgfaP20033 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PdgfaP20033 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PdgfaP20033 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PdgfaP20033 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PdgfaP20033 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PdgfaP20033 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PdgfaP20033 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
PdgfaP20033 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PdgfaP20033 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PdgfaP20033 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
PdgfaP20033 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PdgfaP20033 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PdgfaP20033 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PdgfaP20033 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PdgfaP20033 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PdgfaP20033 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PdgfaP20033 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PdgfaP20033 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PdgfaP20033 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PdgfaP20033 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PdgfaP20033 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PdgfaP20033 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PdgfaP20033 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PdgfaP20033 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PdgfaP20033 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PdgfaP20033 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PdgfaP20033 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PdgfaP20033 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
PdgfaP20033 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC21.52■■□□□ 1.03
PdgfaP20033 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC21.52■■□□□ 1.03
PdgfaP20033 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PdgfaP20033 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PdgfaP20033 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PdgfaP20033 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PdgfaP20033 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PdgfaP20033 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PdgfaP20033 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PdgfaP20033 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
PdgfaP20033 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
PdgfaP20033 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
PdgfaP20033 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PdgfaP20033 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PdgfaP20033 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PdgfaP20033 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PdgfaP20033 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PdgfaP20033 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PdgfaP20033 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PdgfaP20033 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PdgfaP20033 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
PdgfaP20033 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PdgfaP20033 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
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