Protein–RNA interactions for Protein: P19536

Cox5b, Cytochrome c oxidase subunit 5B, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cox5bP19536 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cox5bP19536 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cox5bP19536 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cox5bP19536 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cox5bP19536 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cox5bP19536 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cox5bP19536 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cox5bP19536 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cox5bP19536 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cox5bP19536 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cox5bP19536 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cox5bP19536 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cox5bP19536 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cox5bP19536 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cox5bP19536 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Cox5bP19536 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cox5bP19536 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cox5bP19536 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cox5bP19536 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cox5bP19536 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Cox5bP19536 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cox5bP19536 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cox5bP19536 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cox5bP19536 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cox5bP19536 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cox5bP19536 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cox5bP19536 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cox5bP19536 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cox5bP19536 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cox5bP19536 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cox5bP19536 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cox5bP19536 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cox5bP19536 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cox5bP19536 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cox5bP19536 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cox5bP19536 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cox5bP19536 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cox5bP19536 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cox5bP19536 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cox5bP19536 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Cox5bP19536 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cox5bP19536 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cox5bP19536 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cox5bP19536 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cox5bP19536 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cox5bP19536 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cox5bP19536 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cox5bP19536 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cox5bP19536 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cox5bP19536 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cox5bP19536 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cox5bP19536 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cox5bP19536 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cox5bP19536 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cox5bP19536 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cox5bP19536 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cox5bP19536 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cox5bP19536 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cox5bP19536 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cox5bP19536 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cox5bP19536 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cox5bP19536 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cox5bP19536 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cox5bP19536 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cox5bP19536 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cox5bP19536 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cox5bP19536 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cox5bP19536 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cox5bP19536 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cox5bP19536 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cox5bP19536 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cox5bP19536 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cox5bP19536 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cox5bP19536 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Cox5bP19536 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cox5bP19536 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cox5bP19536 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cox5bP19536 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cox5bP19536 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cox5bP19536 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cox5bP19536 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cox5bP19536 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cox5bP19536 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cox5bP19536 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cox5bP19536 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cox5bP19536 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cox5bP19536 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cox5bP19536 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cox5bP19536 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cox5bP19536 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cox5bP19536 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cox5bP19536 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cox5bP19536 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cox5bP19536 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cox5bP19536 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cox5bP19536 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cox5bP19536 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cox5bP19536 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cox5bP19536 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cox5bP19536 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.4 ms