Protein–RNA interactions for Protein: P17918

Pcna, Proliferating cell nuclear antigen, mousemouse

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcnaP17918 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
PcnaP17918 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PcnaP17918 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PcnaP17918 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PcnaP17918 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PcnaP17918 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PcnaP17918 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PcnaP17918 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PcnaP17918 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PcnaP17918 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PcnaP17918 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PcnaP17918 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PcnaP17918 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PcnaP17918 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
PcnaP17918 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PcnaP17918 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PcnaP17918 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PcnaP17918 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PcnaP17918 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PcnaP17918 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PcnaP17918 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PcnaP17918 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PcnaP17918 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
PcnaP17918 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PcnaP17918 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PcnaP17918 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
PcnaP17918 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PcnaP17918 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PcnaP17918 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PcnaP17918 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PcnaP17918 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PcnaP17918 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PcnaP17918 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PcnaP17918 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PcnaP17918 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PcnaP17918 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PcnaP17918 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PcnaP17918 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PcnaP17918 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PcnaP17918 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
PcnaP17918 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PcnaP17918 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PcnaP17918 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
PcnaP17918 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PcnaP17918 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PcnaP17918 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PcnaP17918 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
PcnaP17918 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PcnaP17918 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PcnaP17918 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
PcnaP17918 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PcnaP17918 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PcnaP17918 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PcnaP17918 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PcnaP17918 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PcnaP17918 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PcnaP17918 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PcnaP17918 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PcnaP17918 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PcnaP17918 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PcnaP17918 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PcnaP17918 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PcnaP17918 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PcnaP17918 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PcnaP17918 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
PcnaP17918 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PcnaP17918 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PcnaP17918 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PcnaP17918 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PcnaP17918 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PcnaP17918 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
PcnaP17918 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PcnaP17918 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PcnaP17918 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PcnaP17918 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PcnaP17918 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PcnaP17918 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PcnaP17918 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PcnaP17918 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PcnaP17918 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PcnaP17918 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PcnaP17918 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PcnaP17918 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PcnaP17918 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PcnaP17918 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PcnaP17918 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PcnaP17918 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PcnaP17918 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PcnaP17918 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PcnaP17918 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PcnaP17918 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PcnaP17918 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PcnaP17918 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
PcnaP17918 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
PcnaP17918 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PcnaP17918 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PcnaP17918 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
PcnaP17918 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PcnaP17918 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PcnaP17918 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
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