Protein–RNA interactions for Protein: P17125

Tgfb3, Transforming growth factor beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgfb3P17125 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tgfb3P17125 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tgfb3P17125 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tgfb3P17125 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tgfb3P17125 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tgfb3P17125 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tgfb3P17125 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tgfb3P17125 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tgfb3P17125 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
Tgfb3P17125 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tgfb3P17125 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tgfb3P17125 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tgfb3P17125 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tgfb3P17125 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tgfb3P17125 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tgfb3P17125 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tgfb3P17125 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tgfb3P17125 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tgfb3P17125 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tgfb3P17125 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tgfb3P17125 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tgfb3P17125 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tgfb3P17125 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tgfb3P17125 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tgfb3P17125 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Tgfb3P17125 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tgfb3P17125 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tgfb3P17125 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tgfb3P17125 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tgfb3P17125 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tgfb3P17125 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tgfb3P17125 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tgfb3P17125 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tgfb3P17125 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tgfb3P17125 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tgfb3P17125 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tgfb3P17125 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tgfb3P17125 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tgfb3P17125 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tgfb3P17125 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tgfb3P17125 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tgfb3P17125 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tgfb3P17125 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tgfb3P17125 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tgfb3P17125 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tgfb3P17125 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tgfb3P17125 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tgfb3P17125 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tgfb3P17125 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Tgfb3P17125 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tgfb3P17125 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tgfb3P17125 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tgfb3P17125 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tgfb3P17125 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tgfb3P17125 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Tgfb3P17125 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tgfb3P17125 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tgfb3P17125 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tgfb3P17125 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tgfb3P17125 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Tgfb3P17125 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tgfb3P17125 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Tgfb3P17125 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tgfb3P17125 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tgfb3P17125 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tgfb3P17125 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tgfb3P17125 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tgfb3P17125 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tgfb3P17125 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tgfb3P17125 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tgfb3P17125 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tgfb3P17125 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tgfb3P17125 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Tgfb3P17125 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Tgfb3P17125 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tgfb3P17125 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tgfb3P17125 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Tgfb3P17125 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tgfb3P17125 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tgfb3P17125 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tgfb3P17125 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Tgfb3P17125 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Tgfb3P17125 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Tgfb3P17125 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Tgfb3P17125 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Tgfb3P17125 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Tgfb3P17125 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tgfb3P17125 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tgfb3P17125 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tgfb3P17125 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Tgfb3P17125 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tgfb3P17125 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tgfb3P17125 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tgfb3P17125 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tgfb3P17125 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tgfb3P17125 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tgfb3P17125 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tgfb3P17125 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tgfb3P17125 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tgfb3P17125 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 94.2 ms