Protein–RNA interactions for Protein: P13373

Vpreb2, Immunoglobulin omega chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb2P13373 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Vpreb2P13373 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Vpreb2P13373 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Vpreb2P13373 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Vpreb2P13373 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Vpreb2P13373 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Vpreb2P13373 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Vpreb2P13373 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Vpreb2P13373 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Vpreb2P13373 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
Vpreb2P13373 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
Vpreb2P13373 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Vpreb2P13373 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
Vpreb2P13373 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
Vpreb2P13373 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
Vpreb2P13373 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Vpreb2P13373 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Vpreb2P13373 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Vpreb2P13373 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Vpreb2P13373 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Vpreb2P13373 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Vpreb2P13373 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Vpreb2P13373 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Vpreb2P13373 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Vpreb2P13373 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Vpreb2P13373 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Vpreb2P13373 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Vpreb2P13373 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Vpreb2P13373 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Vpreb2P13373 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Vpreb2P13373 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Vpreb2P13373 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Vpreb2P13373 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Vpreb2P13373 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Vpreb2P13373 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Vpreb2P13373 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Vpreb2P13373 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Vpreb2P13373 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Vpreb2P13373 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Vpreb2P13373 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Vpreb2P13373 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Vpreb2P13373 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Vpreb2P13373 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Vpreb2P13373 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Vpreb2P13373 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Vpreb2P13373 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Vpreb2P13373 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Vpreb2P13373 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Vpreb2P13373 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Vpreb2P13373 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Vpreb2P13373 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Vpreb2P13373 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Vpreb2P13373 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Vpreb2P13373 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Vpreb2P13373 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Vpreb2P13373 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Vpreb2P13373 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Vpreb2P13373 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Vpreb2P13373 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Vpreb2P13373 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Vpreb2P13373 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Vpreb2P13373 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Vpreb2P13373 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Vpreb2P13373 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Vpreb2P13373 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Vpreb2P13373 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Vpreb2P13373 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Vpreb2P13373 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Vpreb2P13373 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Vpreb2P13373 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Vpreb2P13373 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Vpreb2P13373 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Vpreb2P13373 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Vpreb2P13373 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Vpreb2P13373 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Vpreb2P13373 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
Vpreb2P13373 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
Vpreb2P13373 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Vpreb2P13373 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Vpreb2P13373 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Vpreb2P13373 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Vpreb2P13373 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Vpreb2P13373 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Vpreb2P13373 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Vpreb2P13373 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Vpreb2P13373 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Vpreb2P13373 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Vpreb2P13373 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Vpreb2P13373 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Vpreb2P13373 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Vpreb2P13373 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Vpreb2P13373 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Vpreb2P13373 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Vpreb2P13373 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Vpreb2P13373 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Vpreb2P13373 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Vpreb2P13373 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Vpreb2P13373 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Vpreb2P13373 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Vpreb2P13373 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms