Protein–RNA interactions for Protein: P12813

Nr4a1, Nuclear receptor subfamily 4 group A member 1, mousemouse

Predictions only

Length 601 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr4a1P12813 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nr4a1P12813 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Nr4a1P12813 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nr4a1P12813 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nr4a1P12813 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nr4a1P12813 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nr4a1P12813 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nr4a1P12813 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nr4a1P12813 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Nr4a1P12813 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nr4a1P12813 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nr4a1P12813 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nr4a1P12813 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nr4a1P12813 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nr4a1P12813 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nr4a1P12813 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nr4a1P12813 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nr4a1P12813 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Nr4a1P12813 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nr4a1P12813 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nr4a1P12813 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nr4a1P12813 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nr4a1P12813 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nr4a1P12813 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nr4a1P12813 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nr4a1P12813 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nr4a1P12813 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Nr4a1P12813 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Nr4a1P12813 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Nr4a1P12813 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Nr4a1P12813 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nr4a1P12813 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nr4a1P12813 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nr4a1P12813 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nr4a1P12813 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nr4a1P12813 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nr4a1P12813 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nr4a1P12813 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nr4a1P12813 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nr4a1P12813 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nr4a1P12813 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nr4a1P12813 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Nr4a1P12813 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Nr4a1P12813 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Nr4a1P12813 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Nr4a1P12813 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Nr4a1P12813 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Nr4a1P12813 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nr4a1P12813 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nr4a1P12813 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nr4a1P12813 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nr4a1P12813 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nr4a1P12813 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nr4a1P12813 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nr4a1P12813 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nr4a1P12813 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nr4a1P12813 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nr4a1P12813 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Nr4a1P12813 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nr4a1P12813 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nr4a1P12813 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nr4a1P12813 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nr4a1P12813 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Nr4a1P12813 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nr4a1P12813 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nr4a1P12813 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nr4a1P12813 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nr4a1P12813 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nr4a1P12813 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nr4a1P12813 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nr4a1P12813 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nr4a1P12813 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nr4a1P12813 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nr4a1P12813 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nr4a1P12813 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nr4a1P12813 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nr4a1P12813 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nr4a1P12813 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nr4a1P12813 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nr4a1P12813 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nr4a1P12813 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nr4a1P12813 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nr4a1P12813 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nr4a1P12813 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nr4a1P12813 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nr4a1P12813 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nr4a1P12813 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nr4a1P12813 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nr4a1P12813 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nr4a1P12813 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nr4a1P12813 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nr4a1P12813 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nr4a1P12813 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nr4a1P12813 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nr4a1P12813 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nr4a1P12813 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Nr4a1P12813 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nr4a1P12813 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nr4a1P12813 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nr4a1P12813 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms