Protein–RNA interactions for Protein: P11609

Cd1d1, Antigen-presenting glycoprotein CD1d1, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd1d1P11609 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cd1d1P11609 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cd1d1P11609 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cd1d1P11609 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cd1d1P11609 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cd1d1P11609 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cd1d1P11609 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cd1d1P11609 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cd1d1P11609 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cd1d1P11609 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cd1d1P11609 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cd1d1P11609 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cd1d1P11609 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cd1d1P11609 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cd1d1P11609 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cd1d1P11609 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cd1d1P11609 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cd1d1P11609 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cd1d1P11609 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cd1d1P11609 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cd1d1P11609 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cd1d1P11609 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cd1d1P11609 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cd1d1P11609 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cd1d1P11609 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cd1d1P11609 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cd1d1P11609 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cd1d1P11609 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cd1d1P11609 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cd1d1P11609 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cd1d1P11609 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cd1d1P11609 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cd1d1P11609 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cd1d1P11609 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cd1d1P11609 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cd1d1P11609 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cd1d1P11609 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Cd1d1P11609 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cd1d1P11609 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Cd1d1P11609 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cd1d1P11609 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cd1d1P11609 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cd1d1P11609 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cd1d1P11609 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cd1d1P11609 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cd1d1P11609 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cd1d1P11609 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cd1d1P11609 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cd1d1P11609 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cd1d1P11609 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cd1d1P11609 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cd1d1P11609 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cd1d1P11609 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cd1d1P11609 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cd1d1P11609 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cd1d1P11609 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cd1d1P11609 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cd1d1P11609 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cd1d1P11609 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cd1d1P11609 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cd1d1P11609 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cd1d1P11609 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cd1d1P11609 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cd1d1P11609 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cd1d1P11609 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cd1d1P11609 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Cd1d1P11609 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cd1d1P11609 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cd1d1P11609 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cd1d1P11609 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cd1d1P11609 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cd1d1P11609 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cd1d1P11609 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cd1d1P11609 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cd1d1P11609 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cd1d1P11609 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cd1d1P11609 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cd1d1P11609 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cd1d1P11609 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cd1d1P11609 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cd1d1P11609 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cd1d1P11609 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cd1d1P11609 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cd1d1P11609 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cd1d1P11609 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Cd1d1P11609 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
Cd1d1P11609 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Cd1d1P11609 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Cd1d1P11609 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Cd1d1P11609 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Cd1d1P11609 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cd1d1P11609 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cd1d1P11609 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cd1d1P11609 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cd1d1P11609 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cd1d1P11609 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cd1d1P11609 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cd1d1P11609 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cd1d1P11609 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cd1d1P11609 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.3 ms