Protein–RNA interactions for Protein: P11369

Pol, LINE-1 retrotransposable element ORF2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PolP11369 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PolP11369 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PolP11369 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PolP11369 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PolP11369 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PolP11369 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PolP11369 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PolP11369 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PolP11369 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PolP11369 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PolP11369 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PolP11369 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PolP11369 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PolP11369 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PolP11369 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PolP11369 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PolP11369 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PolP11369 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PolP11369 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PolP11369 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PolP11369 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PolP11369 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PolP11369 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PolP11369 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PolP11369 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PolP11369 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PolP11369 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PolP11369 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PolP11369 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PolP11369 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PolP11369 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PolP11369 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PolP11369 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PolP11369 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PolP11369 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PolP11369 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PolP11369 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PolP11369 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PolP11369 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PolP11369 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PolP11369 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PolP11369 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PolP11369 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PolP11369 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PolP11369 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PolP11369 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PolP11369 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PolP11369 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PolP11369 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PolP11369 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PolP11369 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PolP11369 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PolP11369 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PolP11369 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PolP11369 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PolP11369 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PolP11369 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PolP11369 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PolP11369 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PolP11369 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PolP11369 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PolP11369 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PolP11369 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PolP11369 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PolP11369 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PolP11369 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PolP11369 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PolP11369 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PolP11369 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PolP11369 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PolP11369 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PolP11369 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PolP11369 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PolP11369 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PolP11369 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PolP11369 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PolP11369 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PolP11369 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PolP11369 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PolP11369 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PolP11369 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PolP11369 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PolP11369 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PolP11369 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PolP11369 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PolP11369 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PolP11369 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PolP11369 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PolP11369 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PolP11369 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PolP11369 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PolP11369 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PolP11369 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PolP11369 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PolP11369 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PolP11369 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PolP11369 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PolP11369 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PolP11369 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PolP11369 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms