Protein–RNA interactions for Protein: P10400

Pol, Retrovirus-related Pol polyprotein (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 120 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PolP10400 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PolP10400 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PolP10400 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PolP10400 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PolP10400 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PolP10400 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PolP10400 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PolP10400 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PolP10400 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PolP10400 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PolP10400 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PolP10400 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PolP10400 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PolP10400 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PolP10400 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PolP10400 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PolP10400 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PolP10400 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PolP10400 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PolP10400 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PolP10400 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PolP10400 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PolP10400 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PolP10400 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PolP10400 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PolP10400 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PolP10400 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PolP10400 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PolP10400 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PolP10400 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PolP10400 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PolP10400 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PolP10400 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PolP10400 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PolP10400 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PolP10400 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PolP10400 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PolP10400 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PolP10400 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PolP10400 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PolP10400 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PolP10400 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PolP10400 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PolP10400 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PolP10400 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
PolP10400 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PolP10400 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PolP10400 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PolP10400 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PolP10400 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PolP10400 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PolP10400 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PolP10400 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PolP10400 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PolP10400 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PolP10400 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PolP10400 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PolP10400 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PolP10400 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PolP10400 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PolP10400 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PolP10400 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PolP10400 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PolP10400 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PolP10400 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PolP10400 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PolP10400 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PolP10400 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PolP10400 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PolP10400 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
PolP10400 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PolP10400 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PolP10400 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PolP10400 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PolP10400 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PolP10400 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PolP10400 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PolP10400 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PolP10400 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PolP10400 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PolP10400 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PolP10400 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PolP10400 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PolP10400 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
PolP10400 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PolP10400 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
PolP10400 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PolP10400 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PolP10400 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PolP10400 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PolP10400 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PolP10400 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PolP10400 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PolP10400 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PolP10400 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PolP10400 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PolP10400 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PolP10400 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PolP10400 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PolP10400 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms