Protein–RNA interactions for Protein: P09633

Hoxc9, Homeobox protein Hox-C9, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc9P09633 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Hoxc9P09633 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Hoxc9P09633 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Hoxc9P09633 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Hoxc9P09633 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Hoxc9P09633 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Hoxc9P09633 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Hoxc9P09633 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Hoxc9P09633 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Hoxc9P09633 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Hoxc9P09633 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Hoxc9P09633 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Hoxc9P09633 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Hoxc9P09633 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Hoxc9P09633 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Hoxc9P09633 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Hoxc9P09633 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
Hoxc9P09633 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Hoxc9P09633 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Hoxc9P09633 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Hoxc9P09633 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Hoxc9P09633 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Hoxc9P09633 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
Hoxc9P09633 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Hoxc9P09633 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Hoxc9P09633 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
Hoxc9P09633 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Hoxc9P09633 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Hoxc9P09633 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Hoxc9P09633 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Hoxc9P09633 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Hoxc9P09633 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Hoxc9P09633 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Hoxc9P09633 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
Hoxc9P09633 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Hoxc9P09633 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Hoxc9P09633 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Hoxc9P09633 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Hoxc9P09633 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Hoxc9P09633 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Hoxc9P09633 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Hoxc9P09633 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Hoxc9P09633 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
Hoxc9P09633 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Hoxc9P09633 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Hoxc9P09633 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Hoxc9P09633 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Hoxc9P09633 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Hoxc9P09633 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Hoxc9P09633 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Hoxc9P09633 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Hoxc9P09633 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Hoxc9P09633 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Hoxc9P09633 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Hoxc9P09633 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Hoxc9P09633 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Hoxc9P09633 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Hoxc9P09633 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Hoxc9P09633 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Hoxc9P09633 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Hoxc9P09633 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Hoxc9P09633 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Hoxc9P09633 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Hoxc9P09633 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Hoxc9P09633 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Hoxc9P09633 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Hoxc9P09633 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Hoxc9P09633 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Hoxc9P09633 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Hoxc9P09633 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Hoxc9P09633 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Hoxc9P09633 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Hoxc9P09633 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC28.95■■■□□ 2.23
Hoxc9P09633 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
Hoxc9P09633 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Hoxc9P09633 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Hoxc9P09633 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Hoxc9P09633 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Hoxc9P09633 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Hoxc9P09633 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Hoxc9P09633 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Hoxc9P09633 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Hoxc9P09633 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Hoxc9P09633 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Hoxc9P09633 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Hoxc9P09633 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
Hoxc9P09633 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Hoxc9P09633 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Hoxc9P09633 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Hoxc9P09633 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Hoxc9P09633 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Hoxc9P09633 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Hoxc9P09633 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
Hoxc9P09633 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Hoxc9P09633 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Hoxc9P09633 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Hoxc9P09633 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Hoxc9P09633 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Hoxc9P09633 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Hoxc9P09633 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.4 ms