Protein–RNA interactions for Protein: P09240

Cck, Cholecystokinin, mousemouse

Predictions only

Length 115 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CckP09240 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CckP09240 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CckP09240 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CckP09240 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CckP09240 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CckP09240 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CckP09240 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CckP09240 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CckP09240 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CckP09240 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CckP09240 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CckP09240 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CckP09240 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CckP09240 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CckP09240 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CckP09240 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CckP09240 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CckP09240 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CckP09240 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CckP09240 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CckP09240 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CckP09240 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CckP09240 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CckP09240 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CckP09240 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CckP09240 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CckP09240 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CckP09240 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CckP09240 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CckP09240 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CckP09240 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CckP09240 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CckP09240 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CckP09240 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CckP09240 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CckP09240 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CckP09240 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CckP09240 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CckP09240 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CckP09240 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CckP09240 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CckP09240 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CckP09240 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CckP09240 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CckP09240 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CckP09240 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CckP09240 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CckP09240 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CckP09240 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CckP09240 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CckP09240 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CckP09240 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CckP09240 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CckP09240 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CckP09240 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CckP09240 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CckP09240 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CckP09240 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CckP09240 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CckP09240 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CckP09240 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CckP09240 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CckP09240 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CckP09240 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CckP09240 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CckP09240 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CckP09240 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CckP09240 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CckP09240 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CckP09240 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CckP09240 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CckP09240 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CckP09240 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CckP09240 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CckP09240 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CckP09240 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CckP09240 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CckP09240 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CckP09240 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CckP09240 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CckP09240 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CckP09240 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CckP09240 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CckP09240 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CckP09240 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CckP09240 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CckP09240 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CckP09240 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CckP09240 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CckP09240 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CckP09240 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CckP09240 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CckP09240 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CckP09240 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CckP09240 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CckP09240 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CckP09240 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CckP09240 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC15.03■□□□□ -0
CckP09240 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
CckP09240 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms