Protein–RNA interactions for Protein: P07978

Prm2, Protamine-2, mousemouse

Predictions only

Length 107 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prm2P07978 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Prm2P07978 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Prm2P07978 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Prm2P07978 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Prm2P07978 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Prm2P07978 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Prm2P07978 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Prm2P07978 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Prm2P07978 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Prm2P07978 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Prm2P07978 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Prm2P07978 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Prm2P07978 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Prm2P07978 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Prm2P07978 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Prm2P07978 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Prm2P07978 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Prm2P07978 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Prm2P07978 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Prm2P07978 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Prm2P07978 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Prm2P07978 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Prm2P07978 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Prm2P07978 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Prm2P07978 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Prm2P07978 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Prm2P07978 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Prm2P07978 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Prm2P07978 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Prm2P07978 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Prm2P07978 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Prm2P07978 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Prm2P07978 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Prm2P07978 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Prm2P07978 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Prm2P07978 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Prm2P07978 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Prm2P07978 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Prm2P07978 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Prm2P07978 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Prm2P07978 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Prm2P07978 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Prm2P07978 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Prm2P07978 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Prm2P07978 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Prm2P07978 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Prm2P07978 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Prm2P07978 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Prm2P07978 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Prm2P07978 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Prm2P07978 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Prm2P07978 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Prm2P07978 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Prm2P07978 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Prm2P07978 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Prm2P07978 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Prm2P07978 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Prm2P07978 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Prm2P07978 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Prm2P07978 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Prm2P07978 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Prm2P07978 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Prm2P07978 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Prm2P07978 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Prm2P07978 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Prm2P07978 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Prm2P07978 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Prm2P07978 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Prm2P07978 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Prm2P07978 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Prm2P07978 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Prm2P07978 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Prm2P07978 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Prm2P07978 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Prm2P07978 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Prm2P07978 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Prm2P07978 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Prm2P07978 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Prm2P07978 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Prm2P07978 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Prm2P07978 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Prm2P07978 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Prm2P07978 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Prm2P07978 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Prm2P07978 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Prm2P07978 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Prm2P07978 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Prm2P07978 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Prm2P07978 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Prm2P07978 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Prm2P07978 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Prm2P07978 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Prm2P07978 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Prm2P07978 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Prm2P07978 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Prm2P07978 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Prm2P07978 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Prm2P07978 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Prm2P07978 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Prm2P07978 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms