Protein–RNA interactions for Protein: P04224

H-2 class II histocompatibility antigen, E-K alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P04224 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
P04224 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
P04224 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
P04224 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
P04224 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
P04224 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
P04224 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
P04224 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
P04224 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
P04224 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
P04224 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
P04224 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
P04224 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
P04224 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
P04224 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
P04224 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
P04224 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
P04224 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
P04224 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
P04224 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
P04224 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
P04224 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
P04224 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
P04224 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
P04224 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
P04224 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
P04224 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
P04224 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
P04224 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
P04224 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
P04224 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
P04224 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
P04224 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
P04224 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
P04224 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
P04224 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
P04224 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
P04224 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
P04224 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
P04224 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
P04224 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
P04224 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
P04224 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
P04224 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
P04224 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
P04224 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
P04224 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
P04224 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
P04224 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
P04224 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
P04224 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
P04224 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
P04224 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
P04224 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
P04224 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
P04224 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
P04224 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
P04224 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
P04224 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
P04224 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
P04224 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
P04224 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
P04224 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
P04224 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
P04224 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
P04224 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
P04224 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
P04224 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
P04224 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
P04224 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
P04224 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
P04224 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
P04224 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
P04224 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
P04224 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
P04224 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
P04224 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
P04224 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
P04224 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
P04224 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
P04224 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
P04224 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
P04224 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
P04224 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
P04224 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
P04224 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
P04224 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
P04224 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
P04224 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
P04224 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
P04224 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
P04224 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
P04224 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
P04224 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
P04224 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
P04224 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
P04224 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
P04224 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
P04224 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
P04224 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms