Protein–RNA interactions for Protein: P01921

H2-Ab1, H-2 class II histocompatibility antigen, A-D beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 265 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Ab1P01921 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
H2-Ab1P01921 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
H2-Ab1P01921 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
H2-Ab1P01921 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
H2-Ab1P01921 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
H2-Ab1P01921 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
H2-Ab1P01921 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
H2-Ab1P01921 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
H2-Ab1P01921 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
H2-Ab1P01921 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
H2-Ab1P01921 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
H2-Ab1P01921 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
H2-Ab1P01921 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
H2-Ab1P01921 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
H2-Ab1P01921 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
H2-Ab1P01921 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
H2-Ab1P01921 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
H2-Ab1P01921 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
H2-Ab1P01921 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
H2-Ab1P01921 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
H2-Ab1P01921 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
H2-Ab1P01921 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
H2-Ab1P01921 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
H2-Ab1P01921 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
H2-Ab1P01921 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
H2-Ab1P01921 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
H2-Ab1P01921 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
H2-Ab1P01921 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
H2-Ab1P01921 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
H2-Ab1P01921 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
H2-Ab1P01921 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
H2-Ab1P01921 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
H2-Ab1P01921 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
H2-Ab1P01921 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
H2-Ab1P01921 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
H2-Ab1P01921 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
H2-Ab1P01921 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
H2-Ab1P01921 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
H2-Ab1P01921 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
H2-Ab1P01921 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
H2-Ab1P01921 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
H2-Ab1P01921 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
H2-Ab1P01921 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
H2-Ab1P01921 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
H2-Ab1P01921 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
H2-Ab1P01921 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
H2-Ab1P01921 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
H2-Ab1P01921 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
H2-Ab1P01921 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
H2-Ab1P01921 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
H2-Ab1P01921 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
H2-Ab1P01921 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
H2-Ab1P01921 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
H2-Ab1P01921 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
H2-Ab1P01921 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
H2-Ab1P01921 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
H2-Ab1P01921 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
H2-Ab1P01921 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
H2-Ab1P01921 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
H2-Ab1P01921 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
H2-Ab1P01921 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
H2-Ab1P01921 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
H2-Ab1P01921 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
H2-Ab1P01921 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
H2-Ab1P01921 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
H2-Ab1P01921 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
H2-Ab1P01921 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
H2-Ab1P01921 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
H2-Ab1P01921 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
H2-Ab1P01921 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
H2-Ab1P01921 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
H2-Ab1P01921 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
H2-Ab1P01921 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
H2-Ab1P01921 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
H2-Ab1P01921 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
H2-Ab1P01921 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
H2-Ab1P01921 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
H2-Ab1P01921 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
H2-Ab1P01921 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
H2-Ab1P01921 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
H2-Ab1P01921 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
H2-Ab1P01921 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
H2-Ab1P01921 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
H2-Ab1P01921 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
H2-Ab1P01921 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
H2-Ab1P01921 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
H2-Ab1P01921 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
H2-Ab1P01921 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
H2-Ab1P01921 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
H2-Ab1P01921 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
H2-Ab1P01921 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
H2-Ab1P01921 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
H2-Ab1P01921 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
H2-Ab1P01921 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
H2-Ab1P01921 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
H2-Ab1P01921 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
H2-Ab1P01921 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
H2-Ab1P01921 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
H2-Ab1P01921 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
H2-Ab1P01921 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.5 ms