Protein–RNA interactions for Protein: P01665

Ig kappa chain V-III region PC 7043, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01665 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
P01665 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
P01665 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
P01665 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
P01665 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
P01665 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
P01665 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
P01665 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
P01665 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
P01665 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
P01665 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
P01665 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
P01665 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
P01665 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
P01665 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
P01665 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
P01665 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
P01665 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
P01665 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
P01665 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
P01665 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
P01665 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
P01665 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
P01665 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
P01665 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
P01665 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
P01665 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
P01665 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
P01665 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
P01665 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
P01665 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
P01665 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
P01665 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
P01665 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
P01665 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
P01665 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
P01665 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
P01665 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
P01665 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
P01665 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
P01665 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
P01665 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
P01665 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
P01665 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
P01665 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
P01665 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
P01665 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
P01665 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
P01665 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
P01665 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
P01665 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
P01665 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
P01665 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
P01665 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
P01665 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
P01665 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
P01665 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
P01665 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
P01665 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
P01665 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
P01665 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
P01665 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
P01665 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
P01665 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
P01665 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
P01665 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
P01665 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
P01665 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
P01665 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
P01665 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
P01665 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
P01665 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
P01665 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
P01665 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
P01665 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
P01665 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
P01665 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
P01665 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
P01665 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
P01665 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
P01665 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
P01665 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
P01665 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
P01665 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
P01665 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
P01665 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
P01665 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
P01665 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
P01665 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
P01665 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
P01665 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
P01665 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
P01665 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
P01665 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
P01665 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
P01665 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
P01665 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
P01665 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
P01665 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
P01665 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms