Protein–RNA interactions for Protein: P01648

Ig kappa chain V-V region HP 91A3, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01648 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
P01648 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
P01648 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
P01648 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
P01648 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
P01648 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
P01648 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
P01648 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
P01648 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
P01648 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
P01648 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
P01648 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
P01648 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
P01648 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
P01648 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
P01648 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
P01648 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
P01648 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
P01648 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
P01648 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
P01648 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
P01648 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
P01648 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
P01648 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
P01648 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
P01648 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
P01648 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
P01648 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
P01648 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
P01648 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
P01648 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
P01648 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
P01648 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
P01648 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
P01648 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
P01648 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
P01648 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
P01648 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
P01648 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
P01648 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
P01648 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
P01648 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
P01648 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
P01648 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
P01648 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
P01648 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
P01648 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
P01648 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
P01648 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
P01648 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
P01648 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
P01648 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
P01648 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
P01648 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
P01648 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
P01648 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
P01648 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
P01648 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
P01648 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
P01648 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
P01648 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
P01648 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
P01648 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
P01648 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
P01648 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
P01648 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
P01648 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
P01648 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
P01648 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
P01648 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
P01648 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC23■■□□□ 1.27
P01648 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
P01648 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
P01648 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
P01648 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
P01648 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
P01648 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
P01648 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
P01648 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
P01648 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
P01648 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
P01648 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
P01648 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
P01648 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
P01648 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
P01648 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
P01648 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
P01648 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
P01648 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
P01648 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
P01648 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
P01648 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
P01648 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
P01648 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
P01648 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
P01648 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
P01648 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
P01648 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
P01648 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
P01648 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms