Protein–RNA interactions for Protein: O89026

Robo1, Roundabout homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Robo1O89026 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Robo1O89026 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Robo1O89026 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Robo1O89026 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Robo1O89026 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Robo1O89026 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Robo1O89026 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Robo1O89026 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Robo1O89026 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Robo1O89026 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Robo1O89026 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Robo1O89026 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
Robo1O89026 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Robo1O89026 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
Robo1O89026 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Robo1O89026 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Robo1O89026 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Robo1O89026 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Robo1O89026 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Robo1O89026 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Robo1O89026 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Robo1O89026 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Robo1O89026 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Robo1O89026 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Robo1O89026 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Robo1O89026 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Robo1O89026 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Robo1O89026 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Robo1O89026 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Robo1O89026 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Robo1O89026 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Robo1O89026 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Robo1O89026 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Robo1O89026 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Robo1O89026 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Robo1O89026 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Robo1O89026 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Robo1O89026 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Robo1O89026 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Robo1O89026 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Robo1O89026 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Robo1O89026 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Robo1O89026 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Robo1O89026 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Robo1O89026 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Robo1O89026 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Robo1O89026 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Robo1O89026 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Robo1O89026 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Robo1O89026 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Robo1O89026 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Robo1O89026 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Robo1O89026 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Robo1O89026 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Robo1O89026 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Robo1O89026 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Robo1O89026 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Robo1O89026 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Robo1O89026 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Robo1O89026 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Robo1O89026 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Robo1O89026 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Robo1O89026 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Robo1O89026 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Robo1O89026 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Robo1O89026 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Robo1O89026 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
Robo1O89026 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Robo1O89026 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Robo1O89026 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Robo1O89026 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Robo1O89026 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Robo1O89026 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
Robo1O89026 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Robo1O89026 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Robo1O89026 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Robo1O89026 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Robo1O89026 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Robo1O89026 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Robo1O89026 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Robo1O89026 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Robo1O89026 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
Robo1O89026 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Robo1O89026 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Robo1O89026 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Robo1O89026 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
Robo1O89026 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Robo1O89026 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Robo1O89026 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Robo1O89026 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Robo1O89026 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
Robo1O89026 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
Robo1O89026 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Robo1O89026 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Robo1O89026 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Robo1O89026 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Robo1O89026 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
Robo1O89026 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.27
Robo1O89026 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Robo1O89026 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms