Protein–RNA interactions for Protein: O88974

Setdb1, Histone-lysine N-methyltransferase SETDB1, mousemouse

Predictions only

Length 1,307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Setdb1O88974 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Setdb1O88974 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Setdb1O88974 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Setdb1O88974 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Setdb1O88974 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Setdb1O88974 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Setdb1O88974 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Setdb1O88974 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
Setdb1O88974 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
Setdb1O88974 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
Setdb1O88974 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Setdb1O88974 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Setdb1O88974 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Setdb1O88974 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Setdb1O88974 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
Setdb1O88974 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Setdb1O88974 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Setdb1O88974 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Setdb1O88974 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Setdb1O88974 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Setdb1O88974 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Setdb1O88974 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Setdb1O88974 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Setdb1O88974 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Setdb1O88974 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
Setdb1O88974 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Setdb1O88974 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Setdb1O88974 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Setdb1O88974 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Setdb1O88974 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Setdb1O88974 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Setdb1O88974 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
Setdb1O88974 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
Setdb1O88974 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Setdb1O88974 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Setdb1O88974 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Setdb1O88974 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Setdb1O88974 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Setdb1O88974 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Setdb1O88974 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Setdb1O88974 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Setdb1O88974 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Setdb1O88974 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
Setdb1O88974 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Setdb1O88974 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Setdb1O88974 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Setdb1O88974 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Setdb1O88974 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Setdb1O88974 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Setdb1O88974 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Setdb1O88974 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Setdb1O88974 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Setdb1O88974 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Setdb1O88974 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Setdb1O88974 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Setdb1O88974 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Setdb1O88974 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Setdb1O88974 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
Setdb1O88974 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
Setdb1O88974 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.91
Setdb1O88974 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
Setdb1O88974 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Setdb1O88974 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
Setdb1O88974 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Setdb1O88974 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Setdb1O88974 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Setdb1O88974 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Setdb1O88974 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Setdb1O88974 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Setdb1O88974 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Setdb1O88974 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Setdb1O88974 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Setdb1O88974 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Setdb1O88974 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Setdb1O88974 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Setdb1O88974 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Setdb1O88974 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Setdb1O88974 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Setdb1O88974 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Setdb1O88974 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Setdb1O88974 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Setdb1O88974 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Setdb1O88974 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Setdb1O88974 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Setdb1O88974 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Setdb1O88974 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
Setdb1O88974 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Setdb1O88974 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Setdb1O88974 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Setdb1O88974 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Setdb1O88974 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Setdb1O88974 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Setdb1O88974 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Setdb1O88974 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Setdb1O88974 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Setdb1O88974 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Setdb1O88974 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Setdb1O88974 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Setdb1O88974 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Setdb1O88974 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms