Protein–RNA interactions for Protein: O88703

Hcn2, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 2, mousemouse

Predictions only

Length 863 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hcn2O88703 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Hcn2O88703 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Hcn2O88703 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Hcn2O88703 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Hcn2O88703 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Hcn2O88703 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Hcn2O88703 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Hcn2O88703 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Hcn2O88703 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Hcn2O88703 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Hcn2O88703 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Hcn2O88703 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Hcn2O88703 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Hcn2O88703 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Hcn2O88703 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Hcn2O88703 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Hcn2O88703 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Hcn2O88703 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Hcn2O88703 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Hcn2O88703 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Hcn2O88703 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Hcn2O88703 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Hcn2O88703 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Hcn2O88703 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Hcn2O88703 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Hcn2O88703 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Hcn2O88703 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Hcn2O88703 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Hcn2O88703 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Hcn2O88703 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Hcn2O88703 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Hcn2O88703 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Hcn2O88703 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Hcn2O88703 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Hcn2O88703 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Hcn2O88703 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Hcn2O88703 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Hcn2O88703 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Hcn2O88703 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Hcn2O88703 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Hcn2O88703 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Hcn2O88703 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Hcn2O88703 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Hcn2O88703 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Hcn2O88703 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Hcn2O88703 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Hcn2O88703 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Hcn2O88703 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Hcn2O88703 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Hcn2O88703 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Hcn2O88703 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Hcn2O88703 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Hcn2O88703 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Hcn2O88703 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Hcn2O88703 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Hcn2O88703 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Hcn2O88703 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Hcn2O88703 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Hcn2O88703 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Hcn2O88703 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Hcn2O88703 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Hcn2O88703 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Hcn2O88703 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Hcn2O88703 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Hcn2O88703 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Hcn2O88703 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Hcn2O88703 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Hcn2O88703 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Hcn2O88703 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Hcn2O88703 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Hcn2O88703 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Hcn2O88703 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Hcn2O88703 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
Hcn2O88703 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Hcn2O88703 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Hcn2O88703 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Hcn2O88703 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Hcn2O88703 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Hcn2O88703 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Hcn2O88703 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Hcn2O88703 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Hcn2O88703 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Hcn2O88703 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Hcn2O88703 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Hcn2O88703 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Hcn2O88703 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Hcn2O88703 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Hcn2O88703 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Hcn2O88703 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Hcn2O88703 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Hcn2O88703 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hcn2O88703 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hcn2O88703 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hcn2O88703 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hcn2O88703 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hcn2O88703 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Hcn2O88703 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hcn2O88703 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hcn2O88703 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hcn2O88703 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms