Protein–RNA interactions for Protein: O88451

Rdh7, Retinol dehydrogenase 7, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh7O88451 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rdh7O88451 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Rdh7O88451 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rdh7O88451 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rdh7O88451 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rdh7O88451 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Rdh7O88451 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rdh7O88451 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rdh7O88451 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rdh7O88451 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rdh7O88451 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rdh7O88451 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rdh7O88451 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rdh7O88451 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rdh7O88451 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rdh7O88451 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rdh7O88451 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rdh7O88451 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rdh7O88451 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rdh7O88451 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rdh7O88451 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rdh7O88451 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rdh7O88451 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rdh7O88451 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rdh7O88451 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rdh7O88451 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Rdh7O88451 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rdh7O88451 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rdh7O88451 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rdh7O88451 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rdh7O88451 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rdh7O88451 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rdh7O88451 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Rdh7O88451 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rdh7O88451 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rdh7O88451 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rdh7O88451 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rdh7O88451 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rdh7O88451 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rdh7O88451 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Rdh7O88451 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rdh7O88451 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rdh7O88451 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Rdh7O88451 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rdh7O88451 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rdh7O88451 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rdh7O88451 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Rdh7O88451 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Rdh7O88451 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Rdh7O88451 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Rdh7O88451 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rdh7O88451 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rdh7O88451 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Rdh7O88451 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rdh7O88451 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rdh7O88451 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rdh7O88451 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rdh7O88451 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rdh7O88451 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rdh7O88451 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rdh7O88451 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rdh7O88451 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rdh7O88451 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rdh7O88451 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rdh7O88451 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rdh7O88451 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rdh7O88451 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rdh7O88451 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rdh7O88451 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rdh7O88451 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rdh7O88451 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rdh7O88451 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rdh7O88451 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rdh7O88451 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rdh7O88451 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rdh7O88451 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rdh7O88451 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rdh7O88451 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rdh7O88451 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rdh7O88451 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rdh7O88451 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rdh7O88451 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rdh7O88451 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Rdh7O88451 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rdh7O88451 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rdh7O88451 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rdh7O88451 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rdh7O88451 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rdh7O88451 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Rdh7O88451 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Rdh7O88451 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rdh7O88451 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rdh7O88451 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rdh7O88451 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rdh7O88451 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rdh7O88451 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rdh7O88451 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rdh7O88451 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rdh7O88451 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rdh7O88451 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms