Protein–RNA interactions for Protein: O88398

Avil, Advillin, mousemouse

Predictions only

Length 819 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AvilO88398 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
AvilO88398 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
AvilO88398 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
AvilO88398 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
AvilO88398 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
AvilO88398 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
AvilO88398 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
AvilO88398 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
AvilO88398 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
AvilO88398 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
AvilO88398 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
AvilO88398 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
AvilO88398 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
AvilO88398 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
AvilO88398 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
AvilO88398 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
AvilO88398 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
AvilO88398 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
AvilO88398 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
AvilO88398 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
AvilO88398 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
AvilO88398 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
AvilO88398 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
AvilO88398 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
AvilO88398 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
AvilO88398 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
AvilO88398 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
AvilO88398 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
AvilO88398 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
AvilO88398 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
AvilO88398 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
AvilO88398 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
AvilO88398 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
AvilO88398 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
AvilO88398 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
AvilO88398 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
AvilO88398 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
AvilO88398 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
AvilO88398 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
AvilO88398 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
AvilO88398 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
AvilO88398 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
AvilO88398 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
AvilO88398 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
AvilO88398 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
AvilO88398 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
AvilO88398 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
AvilO88398 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
AvilO88398 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
AvilO88398 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
AvilO88398 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
AvilO88398 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
AvilO88398 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
AvilO88398 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
AvilO88398 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
AvilO88398 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
AvilO88398 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
AvilO88398 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
AvilO88398 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
AvilO88398 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
AvilO88398 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
AvilO88398 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
AvilO88398 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
AvilO88398 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
AvilO88398 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
AvilO88398 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
AvilO88398 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
AvilO88398 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
AvilO88398 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
AvilO88398 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
AvilO88398 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
AvilO88398 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
AvilO88398 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
AvilO88398 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
AvilO88398 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
AvilO88398 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
AvilO88398 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
AvilO88398 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
AvilO88398 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
AvilO88398 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
AvilO88398 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
AvilO88398 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
AvilO88398 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
AvilO88398 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
AvilO88398 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
AvilO88398 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
AvilO88398 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
AvilO88398 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
AvilO88398 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
AvilO88398 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
AvilO88398 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
AvilO88398 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
AvilO88398 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
AvilO88398 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
AvilO88398 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
AvilO88398 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
AvilO88398 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
AvilO88398 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
AvilO88398 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
AvilO88398 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.3 ms