Protein–RNA interactions for Protein: O70492

Snx3, Sorting nexin-3, mousemouse

Predictions only

Length 162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx3O70492 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Snx3O70492 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Snx3O70492 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Snx3O70492 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Snx3O70492 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Snx3O70492 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Snx3O70492 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Snx3O70492 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Snx3O70492 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Snx3O70492 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Snx3O70492 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Snx3O70492 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Snx3O70492 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Snx3O70492 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Snx3O70492 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Snx3O70492 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Snx3O70492 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Snx3O70492 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Snx3O70492 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Snx3O70492 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Snx3O70492 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Snx3O70492 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Snx3O70492 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Snx3O70492 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Snx3O70492 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Snx3O70492 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Snx3O70492 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Snx3O70492 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Snx3O70492 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Snx3O70492 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Snx3O70492 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Snx3O70492 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Snx3O70492 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Snx3O70492 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Snx3O70492 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Snx3O70492 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Snx3O70492 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Snx3O70492 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Snx3O70492 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Snx3O70492 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Snx3O70492 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Snx3O70492 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Snx3O70492 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Snx3O70492 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Snx3O70492 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Snx3O70492 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Snx3O70492 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Snx3O70492 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Snx3O70492 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Snx3O70492 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Snx3O70492 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Snx3O70492 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Snx3O70492 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Snx3O70492 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Snx3O70492 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Snx3O70492 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Snx3O70492 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Snx3O70492 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Snx3O70492 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Snx3O70492 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Snx3O70492 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Snx3O70492 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Snx3O70492 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Snx3O70492 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Snx3O70492 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Snx3O70492 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Snx3O70492 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Snx3O70492 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Snx3O70492 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
Snx3O70492 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Snx3O70492 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Snx3O70492 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Snx3O70492 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Snx3O70492 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Snx3O70492 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Snx3O70492 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Snx3O70492 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Snx3O70492 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Snx3O70492 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Snx3O70492 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Snx3O70492 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Snx3O70492 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Snx3O70492 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Snx3O70492 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Snx3O70492 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Snx3O70492 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Snx3O70492 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Snx3O70492 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Snx3O70492 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Snx3O70492 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Snx3O70492 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Snx3O70492 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Snx3O70492 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Snx3O70492 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Snx3O70492 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Snx3O70492 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Snx3O70492 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Snx3O70492 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Snx3O70492 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Snx3O70492 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms