Protein–RNA interactions for Protein: O70373

Xirp1, Xin actin-binding repeat-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xirp1O70373 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Xirp1O70373 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Xirp1O70373 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Xirp1O70373 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Xirp1O70373 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Xirp1O70373 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Xirp1O70373 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Xirp1O70373 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Xirp1O70373 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Xirp1O70373 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Xirp1O70373 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Xirp1O70373 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Xirp1O70373 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Xirp1O70373 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Xirp1O70373 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
Xirp1O70373 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Xirp1O70373 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Xirp1O70373 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Xirp1O70373 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Xirp1O70373 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Xirp1O70373 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Xirp1O70373 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Xirp1O70373 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Xirp1O70373 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Xirp1O70373 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Xirp1O70373 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Xirp1O70373 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Xirp1O70373 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Xirp1O70373 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Xirp1O70373 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Xirp1O70373 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Xirp1O70373 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Xirp1O70373 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Xirp1O70373 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Xirp1O70373 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Xirp1O70373 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Xirp1O70373 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Xirp1O70373 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Xirp1O70373 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Xirp1O70373 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Xirp1O70373 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Xirp1O70373 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Xirp1O70373 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Xirp1O70373 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Xirp1O70373 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Xirp1O70373 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Xirp1O70373 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Xirp1O70373 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Xirp1O70373 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Xirp1O70373 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Xirp1O70373 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Xirp1O70373 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Xirp1O70373 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Xirp1O70373 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Xirp1O70373 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Xirp1O70373 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Xirp1O70373 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Xirp1O70373 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Xirp1O70373 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Xirp1O70373 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Xirp1O70373 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Xirp1O70373 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Xirp1O70373 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Xirp1O70373 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Xirp1O70373 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Xirp1O70373 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Xirp1O70373 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Xirp1O70373 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Xirp1O70373 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Xirp1O70373 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Xirp1O70373 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Xirp1O70373 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Xirp1O70373 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Xirp1O70373 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Xirp1O70373 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Xirp1O70373 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Xirp1O70373 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Xirp1O70373 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Xirp1O70373 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Xirp1O70373 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Xirp1O70373 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Xirp1O70373 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Xirp1O70373 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Xirp1O70373 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Xirp1O70373 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Xirp1O70373 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Xirp1O70373 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Xirp1O70373 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Xirp1O70373 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Xirp1O70373 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Xirp1O70373 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Xirp1O70373 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Xirp1O70373 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Xirp1O70373 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Xirp1O70373 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Xirp1O70373 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Xirp1O70373 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Xirp1O70373 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Xirp1O70373 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Xirp1O70373 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms