Protein–RNA interactions for Protein: O55222

Ilk, Integrin-linked protein kinase, mousemouse

Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IlkO55222 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
IlkO55222 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
IlkO55222 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
IlkO55222 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
IlkO55222 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
IlkO55222 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
IlkO55222 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
IlkO55222 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
IlkO55222 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
IlkO55222 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
IlkO55222 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
IlkO55222 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
IlkO55222 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
IlkO55222 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
IlkO55222 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
IlkO55222 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
IlkO55222 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
IlkO55222 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
IlkO55222 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
IlkO55222 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
IlkO55222 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
IlkO55222 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
IlkO55222 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
IlkO55222 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
IlkO55222 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
IlkO55222 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
IlkO55222 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
IlkO55222 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
IlkO55222 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
IlkO55222 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
IlkO55222 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
IlkO55222 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
IlkO55222 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
IlkO55222 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
IlkO55222 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
IlkO55222 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
IlkO55222 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC21.32■■□□□ 1
IlkO55222 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
IlkO55222 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
IlkO55222 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
IlkO55222 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
IlkO55222 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
IlkO55222 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
IlkO55222 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
IlkO55222 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
IlkO55222 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
IlkO55222 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC21.3■■□□□ 1
IlkO55222 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
IlkO55222 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
IlkO55222 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
IlkO55222 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
IlkO55222 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
IlkO55222 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
IlkO55222 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
IlkO55222 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
IlkO55222 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
IlkO55222 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
IlkO55222 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
IlkO55222 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
IlkO55222 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
IlkO55222 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
IlkO55222 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
IlkO55222 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
IlkO55222 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC21.28■■□□□ 1
IlkO55222 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
IlkO55222 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
IlkO55222 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC21.27■■□□□ 1
IlkO55222 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
IlkO55222 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
IlkO55222 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
IlkO55222 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
IlkO55222 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
IlkO55222 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
IlkO55222 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
IlkO55222 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
IlkO55222 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
IlkO55222 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
IlkO55222 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
IlkO55222 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
IlkO55222 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
IlkO55222 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
IlkO55222 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
IlkO55222 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
IlkO55222 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
IlkO55222 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
IlkO55222 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
IlkO55222 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
IlkO55222 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
IlkO55222 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
IlkO55222 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
IlkO55222 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
IlkO55222 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
IlkO55222 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
IlkO55222 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
IlkO55222 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
IlkO55222 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
IlkO55222 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
IlkO55222 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
IlkO55222 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
IlkO55222 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.1 ms