Protein–RNA interactions for Protein: O55143

Atp2a2, Sarcoplasmic/endoplasmic reticulum calcium ATPase 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp2a2O55143 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Atp2a2O55143 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Atp2a2O55143 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Atp2a2O55143 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Atp2a2O55143 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Atp2a2O55143 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Atp2a2O55143 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Atp2a2O55143 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Atp2a2O55143 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Atp2a2O55143 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Atp2a2O55143 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Atp2a2O55143 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Atp2a2O55143 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Atp2a2O55143 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Atp2a2O55143 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Atp2a2O55143 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Atp2a2O55143 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Atp2a2O55143 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Atp2a2O55143 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Atp2a2O55143 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Atp2a2O55143 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Atp2a2O55143 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Atp2a2O55143 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Atp2a2O55143 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Atp2a2O55143 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Atp2a2O55143 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Atp2a2O55143 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Atp2a2O55143 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Atp2a2O55143 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Atp2a2O55143 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Atp2a2O55143 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Atp2a2O55143 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Atp2a2O55143 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Atp2a2O55143 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Atp2a2O55143 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Atp2a2O55143 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Atp2a2O55143 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Atp2a2O55143 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Atp2a2O55143 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Atp2a2O55143 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Atp2a2O55143 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Atp2a2O55143 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Atp2a2O55143 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Atp2a2O55143 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Atp2a2O55143 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Atp2a2O55143 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Atp2a2O55143 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Atp2a2O55143 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Atp2a2O55143 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Atp2a2O55143 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Atp2a2O55143 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Atp2a2O55143 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Atp2a2O55143 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Atp2a2O55143 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Atp2a2O55143 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Atp2a2O55143 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Atp2a2O55143 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Atp2a2O55143 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Atp2a2O55143 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Atp2a2O55143 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Atp2a2O55143 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Atp2a2O55143 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Atp2a2O55143 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Atp2a2O55143 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Atp2a2O55143 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Atp2a2O55143 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Atp2a2O55143 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Atp2a2O55143 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Atp2a2O55143 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Atp2a2O55143 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Atp2a2O55143 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Atp2a2O55143 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Atp2a2O55143 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Atp2a2O55143 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Atp2a2O55143 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Atp2a2O55143 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Atp2a2O55143 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Atp2a2O55143 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Atp2a2O55143 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Atp2a2O55143 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.95■■□□□ 1.27
Atp2a2O55143 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Atp2a2O55143 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Atp2a2O55143 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Atp2a2O55143 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Atp2a2O55143 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Atp2a2O55143 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Atp2a2O55143 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Atp2a2O55143 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Atp2a2O55143 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Atp2a2O55143 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Atp2a2O55143 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Atp2a2O55143 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Atp2a2O55143 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Atp2a2O55143 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Atp2a2O55143 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Atp2a2O55143 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Atp2a2O55143 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Atp2a2O55143 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Atp2a2O55143 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Atp2a2O55143 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms