Protein–RNA interactions for Protein: O55142

Rpl35a, 60S ribosomal protein L35a, mousemouse

Predictions only

Length 110 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl35aO55142 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rpl35aO55142 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rpl35aO55142 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rpl35aO55142 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rpl35aO55142 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rpl35aO55142 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rpl35aO55142 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rpl35aO55142 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rpl35aO55142 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rpl35aO55142 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rpl35aO55142 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rpl35aO55142 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rpl35aO55142 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rpl35aO55142 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rpl35aO55142 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rpl35aO55142 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rpl35aO55142 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rpl35aO55142 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rpl35aO55142 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rpl35aO55142 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rpl35aO55142 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rpl35aO55142 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rpl35aO55142 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rpl35aO55142 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rpl35aO55142 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rpl35aO55142 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rpl35aO55142 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rpl35aO55142 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rpl35aO55142 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rpl35aO55142 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rpl35aO55142 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rpl35aO55142 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rpl35aO55142 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rpl35aO55142 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rpl35aO55142 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rpl35aO55142 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rpl35aO55142 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rpl35aO55142 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rpl35aO55142 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Rpl35aO55142 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Rpl35aO55142 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rpl35aO55142 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rpl35aO55142 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rpl35aO55142 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rpl35aO55142 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rpl35aO55142 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rpl35aO55142 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rpl35aO55142 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rpl35aO55142 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rpl35aO55142 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rpl35aO55142 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rpl35aO55142 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rpl35aO55142 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rpl35aO55142 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rpl35aO55142 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rpl35aO55142 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rpl35aO55142 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rpl35aO55142 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rpl35aO55142 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rpl35aO55142 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rpl35aO55142 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rpl35aO55142 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rpl35aO55142 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rpl35aO55142 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rpl35aO55142 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rpl35aO55142 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rpl35aO55142 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rpl35aO55142 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rpl35aO55142 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rpl35aO55142 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rpl35aO55142 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rpl35aO55142 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rpl35aO55142 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rpl35aO55142 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rpl35aO55142 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Rpl35aO55142 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rpl35aO55142 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rpl35aO55142 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rpl35aO55142 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rpl35aO55142 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rpl35aO55142 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rpl35aO55142 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rpl35aO55142 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Rpl35aO55142 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rpl35aO55142 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rpl35aO55142 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rpl35aO55142 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rpl35aO55142 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rpl35aO55142 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rpl35aO55142 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rpl35aO55142 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rpl35aO55142 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rpl35aO55142 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rpl35aO55142 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rpl35aO55142 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rpl35aO55142 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rpl35aO55142 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rpl35aO55142 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rpl35aO55142 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rpl35aO55142 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms