Protein–RNA interactions for Protein: O55137

Acot1, Acyl-coenzyme A thioesterase 1, mousemouse

Predictions only

Length 419 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acot1O55137 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Acot1O55137 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Acot1O55137 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Acot1O55137 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Acot1O55137 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Acot1O55137 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Acot1O55137 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Acot1O55137 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Acot1O55137 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Acot1O55137 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Acot1O55137 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Acot1O55137 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Acot1O55137 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Acot1O55137 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Acot1O55137 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Acot1O55137 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Acot1O55137 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Acot1O55137 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Acot1O55137 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Acot1O55137 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Acot1O55137 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Acot1O55137 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Acot1O55137 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Acot1O55137 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Acot1O55137 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Acot1O55137 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Acot1O55137 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Acot1O55137 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Acot1O55137 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Acot1O55137 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Acot1O55137 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Acot1O55137 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Acot1O55137 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Acot1O55137 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Acot1O55137 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Acot1O55137 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Acot1O55137 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Acot1O55137 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Acot1O55137 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Acot1O55137 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Acot1O55137 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Acot1O55137 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Acot1O55137 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Acot1O55137 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Acot1O55137 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Acot1O55137 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Acot1O55137 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Acot1O55137 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Acot1O55137 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Acot1O55137 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Acot1O55137 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Acot1O55137 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Acot1O55137 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Acot1O55137 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Acot1O55137 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Acot1O55137 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Acot1O55137 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Acot1O55137 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Acot1O55137 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Acot1O55137 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Acot1O55137 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Acot1O55137 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Acot1O55137 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Acot1O55137 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Acot1O55137 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Acot1O55137 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Acot1O55137 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Acot1O55137 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Acot1O55137 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Acot1O55137 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Acot1O55137 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Acot1O55137 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Acot1O55137 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Acot1O55137 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Acot1O55137 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Acot1O55137 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Acot1O55137 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Acot1O55137 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Acot1O55137 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Acot1O55137 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Acot1O55137 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Acot1O55137 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Acot1O55137 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Acot1O55137 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Acot1O55137 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Acot1O55137 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Acot1O55137 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Acot1O55137 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Acot1O55137 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Acot1O55137 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Acot1O55137 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Acot1O55137 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Acot1O55137 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Acot1O55137 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Acot1O55137 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Acot1O55137 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Acot1O55137 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Acot1O55137 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Acot1O55137 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Acot1O55137 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.8 ms