Protein–RNA interactions for Protein: O55013

Trappc3, Trafficking protein particle complex subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc3O55013 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Trappc3O55013 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Trappc3O55013 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Trappc3O55013 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Trappc3O55013 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Trappc3O55013 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Trappc3O55013 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Trappc3O55013 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Trappc3O55013 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Trappc3O55013 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Trappc3O55013 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Trappc3O55013 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Trappc3O55013 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Trappc3O55013 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Trappc3O55013 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Trappc3O55013 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Trappc3O55013 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Trappc3O55013 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Trappc3O55013 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Trappc3O55013 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Trappc3O55013 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Trappc3O55013 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Trappc3O55013 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Trappc3O55013 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Trappc3O55013 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Trappc3O55013 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Trappc3O55013 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Trappc3O55013 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Trappc3O55013 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Trappc3O55013 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Trappc3O55013 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Trappc3O55013 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Trappc3O55013 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Trappc3O55013 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Trappc3O55013 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Trappc3O55013 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trappc3O55013 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trappc3O55013 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trappc3O55013 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trappc3O55013 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trappc3O55013 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trappc3O55013 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trappc3O55013 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trappc3O55013 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trappc3O55013 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trappc3O55013 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trappc3O55013 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trappc3O55013 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trappc3O55013 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trappc3O55013 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Trappc3O55013 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Trappc3O55013 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Trappc3O55013 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Trappc3O55013 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Trappc3O55013 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trappc3O55013 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trappc3O55013 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Trappc3O55013 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
Trappc3O55013 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Trappc3O55013 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Trappc3O55013 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Trappc3O55013 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Trappc3O55013 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Trappc3O55013 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Trappc3O55013 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trappc3O55013 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trappc3O55013 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trappc3O55013 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Trappc3O55013 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trappc3O55013 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trappc3O55013 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trappc3O55013 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trappc3O55013 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Trappc3O55013 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Trappc3O55013 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Trappc3O55013 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Trappc3O55013 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Trappc3O55013 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Trappc3O55013 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Trappc3O55013 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Trappc3O55013 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Trappc3O55013 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Trappc3O55013 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Trappc3O55013 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Trappc3O55013 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Trappc3O55013 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Trappc3O55013 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Trappc3O55013 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Trappc3O55013 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Trappc3O55013 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Trappc3O55013 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Trappc3O55013 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Trappc3O55013 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Trappc3O55013 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Trappc3O55013 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Trappc3O55013 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Trappc3O55013 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Trappc3O55013 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Trappc3O55013 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Trappc3O55013 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14 ms