Protein–RNA interactions for Protein: O54990

Prom1, Prominin-1, mousemouse

Predictions only

Length 867 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prom1O54990 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Prom1O54990 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Prom1O54990 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Prom1O54990 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Prom1O54990 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Prom1O54990 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Prom1O54990 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Prom1O54990 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Prom1O54990 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Prom1O54990 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Prom1O54990 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Prom1O54990 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Prom1O54990 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Prom1O54990 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Prom1O54990 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Prom1O54990 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Prom1O54990 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Prom1O54990 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Prom1O54990 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Prom1O54990 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Prom1O54990 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Prom1O54990 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Prom1O54990 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Prom1O54990 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Prom1O54990 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Prom1O54990 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Prom1O54990 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Prom1O54990 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Prom1O54990 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Prom1O54990 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Prom1O54990 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Prom1O54990 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Prom1O54990 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Prom1O54990 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Prom1O54990 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Prom1O54990 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Prom1O54990 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Prom1O54990 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Prom1O54990 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Prom1O54990 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Prom1O54990 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Prom1O54990 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Prom1O54990 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Prom1O54990 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Prom1O54990 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Prom1O54990 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Prom1O54990 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Prom1O54990 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Prom1O54990 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Prom1O54990 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Prom1O54990 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Prom1O54990 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Prom1O54990 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Prom1O54990 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Prom1O54990 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Prom1O54990 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Prom1O54990 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Prom1O54990 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Prom1O54990 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Prom1O54990 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Prom1O54990 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Prom1O54990 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Prom1O54990 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Prom1O54990 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Prom1O54990 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Prom1O54990 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Prom1O54990 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Prom1O54990 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Prom1O54990 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Prom1O54990 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Prom1O54990 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Prom1O54990 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Prom1O54990 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Prom1O54990 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Prom1O54990 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Prom1O54990 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Prom1O54990 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Prom1O54990 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Prom1O54990 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Prom1O54990 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Prom1O54990 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Prom1O54990 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Prom1O54990 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Prom1O54990 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Prom1O54990 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Prom1O54990 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Prom1O54990 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Prom1O54990 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Prom1O54990 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Prom1O54990 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Prom1O54990 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Prom1O54990 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Prom1O54990 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Prom1O54990 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Prom1O54990 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Prom1O54990 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Prom1O54990 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Prom1O54990 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Prom1O54990 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Prom1O54990 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms