Protein–RNA interactions for Protein: O35448

Ppt2, Lysosomal thioesterase PPT2, mousemouse

Predictions only

Length 302 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppt2O35448 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ppt2O35448 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ppt2O35448 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ppt2O35448 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ppt2O35448 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ppt2O35448 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ppt2O35448 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ppt2O35448 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ppt2O35448 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ppt2O35448 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ppt2O35448 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ppt2O35448 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ppt2O35448 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ppt2O35448 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ppt2O35448 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ppt2O35448 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ppt2O35448 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ppt2O35448 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ppt2O35448 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ppt2O35448 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ppt2O35448 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Ppt2O35448 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Ppt2O35448 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ppt2O35448 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ppt2O35448 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ppt2O35448 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ppt2O35448 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ppt2O35448 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ppt2O35448 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ppt2O35448 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Ppt2O35448 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Ppt2O35448 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ppt2O35448 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ppt2O35448 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Ppt2O35448 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Ppt2O35448 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ppt2O35448 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ppt2O35448 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ppt2O35448 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ppt2O35448 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ppt2O35448 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ppt2O35448 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ppt2O35448 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ppt2O35448 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ppt2O35448 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ppt2O35448 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ppt2O35448 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ppt2O35448 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ppt2O35448 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ppt2O35448 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ppt2O35448 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ppt2O35448 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ppt2O35448 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ppt2O35448 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ppt2O35448 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ppt2O35448 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ppt2O35448 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ppt2O35448 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ppt2O35448 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ppt2O35448 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ppt2O35448 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ppt2O35448 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ppt2O35448 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ppt2O35448 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ppt2O35448 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ppt2O35448 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ppt2O35448 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Ppt2O35448 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ppt2O35448 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ppt2O35448 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ppt2O35448 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ppt2O35448 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ppt2O35448 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ppt2O35448 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ppt2O35448 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ppt2O35448 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ppt2O35448 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ppt2O35448 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ppt2O35448 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Ppt2O35448 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ppt2O35448 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ppt2O35448 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ppt2O35448 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ppt2O35448 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ppt2O35448 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ppt2O35448 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ppt2O35448 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
Ppt2O35448 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ppt2O35448 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ppt2O35448 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ppt2O35448 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ppt2O35448 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ppt2O35448 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ppt2O35448 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ppt2O35448 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ppt2O35448 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ppt2O35448 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ppt2O35448 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ppt2O35448 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ppt2O35448 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 98.5 ms