Protein–RNA interactions for Protein: O35304

Slc18a3, Vesicular acetylcholine transporter, mousemouse

Predictions only

Length 530 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc18a3O35304 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Slc18a3O35304 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Slc18a3O35304 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Slc18a3O35304 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Slc18a3O35304 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Slc18a3O35304 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Slc18a3O35304 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Slc18a3O35304 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Slc18a3O35304 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Slc18a3O35304 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Slc18a3O35304 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Slc18a3O35304 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Slc18a3O35304 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Slc18a3O35304 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Slc18a3O35304 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Slc18a3O35304 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Slc18a3O35304 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Slc18a3O35304 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Slc18a3O35304 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Slc18a3O35304 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Slc18a3O35304 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Slc18a3O35304 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Slc18a3O35304 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Slc18a3O35304 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Slc18a3O35304 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Slc18a3O35304 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Slc18a3O35304 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Slc18a3O35304 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Slc18a3O35304 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Slc18a3O35304 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Slc18a3O35304 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Slc18a3O35304 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Slc18a3O35304 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Slc18a3O35304 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Slc18a3O35304 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Slc18a3O35304 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Slc18a3O35304 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Slc18a3O35304 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Slc18a3O35304 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Slc18a3O35304 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Slc18a3O35304 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Slc18a3O35304 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Slc18a3O35304 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Slc18a3O35304 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Slc18a3O35304 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Slc18a3O35304 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Slc18a3O35304 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Slc18a3O35304 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Slc18a3O35304 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Slc18a3O35304 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Slc18a3O35304 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Slc18a3O35304 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Slc18a3O35304 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Slc18a3O35304 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Slc18a3O35304 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Slc18a3O35304 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Slc18a3O35304 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Slc18a3O35304 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Slc18a3O35304 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Slc18a3O35304 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Slc18a3O35304 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Slc18a3O35304 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Slc18a3O35304 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Slc18a3O35304 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Slc18a3O35304 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Slc18a3O35304 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Slc18a3O35304 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Slc18a3O35304 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Slc18a3O35304 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Slc18a3O35304 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Slc18a3O35304 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Slc18a3O35304 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Slc18a3O35304 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Slc18a3O35304 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Slc18a3O35304 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Slc18a3O35304 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Slc18a3O35304 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Slc18a3O35304 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Slc18a3O35304 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Slc18a3O35304 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Slc18a3O35304 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Slc18a3O35304 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Slc18a3O35304 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Slc18a3O35304 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Slc18a3O35304 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Slc18a3O35304 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Slc18a3O35304 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Slc18a3O35304 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Slc18a3O35304 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Slc18a3O35304 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Slc18a3O35304 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Slc18a3O35304 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Slc18a3O35304 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Slc18a3O35304 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Slc18a3O35304 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Slc18a3O35304 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Slc18a3O35304 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Slc18a3O35304 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Slc18a3O35304 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Slc18a3O35304 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
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