Protein–RNA interactions for Protein: O35074

Ptgis, Prostacyclin synthase, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtgisO35074 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PtgisO35074 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PtgisO35074 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PtgisO35074 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PtgisO35074 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PtgisO35074 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PtgisO35074 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PtgisO35074 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PtgisO35074 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PtgisO35074 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PtgisO35074 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PtgisO35074 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PtgisO35074 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PtgisO35074 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PtgisO35074 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PtgisO35074 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PtgisO35074 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PtgisO35074 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
PtgisO35074 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PtgisO35074 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PtgisO35074 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PtgisO35074 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PtgisO35074 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
PtgisO35074 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PtgisO35074 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PtgisO35074 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PtgisO35074 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PtgisO35074 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PtgisO35074 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PtgisO35074 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PtgisO35074 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PtgisO35074 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PtgisO35074 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PtgisO35074 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PtgisO35074 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PtgisO35074 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PtgisO35074 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PtgisO35074 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PtgisO35074 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
PtgisO35074 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PtgisO35074 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PtgisO35074 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PtgisO35074 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PtgisO35074 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PtgisO35074 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PtgisO35074 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PtgisO35074 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PtgisO35074 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PtgisO35074 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PtgisO35074 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PtgisO35074 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PtgisO35074 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PtgisO35074 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PtgisO35074 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PtgisO35074 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PtgisO35074 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PtgisO35074 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PtgisO35074 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PtgisO35074 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PtgisO35074 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PtgisO35074 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PtgisO35074 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PtgisO35074 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PtgisO35074 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PtgisO35074 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PtgisO35074 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PtgisO35074 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PtgisO35074 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
PtgisO35074 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PtgisO35074 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PtgisO35074 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PtgisO35074 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PtgisO35074 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
PtgisO35074 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PtgisO35074 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PtgisO35074 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PtgisO35074 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
PtgisO35074 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PtgisO35074 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PtgisO35074 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PtgisO35074 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PtgisO35074 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PtgisO35074 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PtgisO35074 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PtgisO35074 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PtgisO35074 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PtgisO35074 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PtgisO35074 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PtgisO35074 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PtgisO35074 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PtgisO35074 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PtgisO35074 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PtgisO35074 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PtgisO35074 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
PtgisO35074 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PtgisO35074 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PtgisO35074 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PtgisO35074 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
PtgisO35074 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PtgisO35074 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms