Protein–RNA interactions for Protein: O35054

Cldn4, Claudin-4, mousemouse

Predictions only

Length 210 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn4O35054 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Cldn4O35054 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cldn4O35054 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cldn4O35054 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cldn4O35054 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cldn4O35054 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cldn4O35054 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cldn4O35054 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cldn4O35054 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cldn4O35054 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cldn4O35054 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cldn4O35054 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cldn4O35054 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cldn4O35054 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cldn4O35054 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cldn4O35054 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cldn4O35054 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cldn4O35054 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cldn4O35054 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cldn4O35054 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Cldn4O35054 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Cldn4O35054 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Cldn4O35054 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cldn4O35054 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cldn4O35054 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cldn4O35054 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cldn4O35054 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cldn4O35054 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cldn4O35054 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cldn4O35054 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cldn4O35054 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cldn4O35054 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cldn4O35054 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cldn4O35054 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cldn4O35054 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cldn4O35054 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cldn4O35054 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cldn4O35054 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cldn4O35054 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cldn4O35054 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cldn4O35054 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cldn4O35054 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cldn4O35054 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cldn4O35054 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cldn4O35054 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cldn4O35054 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cldn4O35054 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cldn4O35054 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cldn4O35054 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Cldn4O35054 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cldn4O35054 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cldn4O35054 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cldn4O35054 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cldn4O35054 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cldn4O35054 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cldn4O35054 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cldn4O35054 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cldn4O35054 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cldn4O35054 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cldn4O35054 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cldn4O35054 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cldn4O35054 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cldn4O35054 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cldn4O35054 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cldn4O35054 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cldn4O35054 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cldn4O35054 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cldn4O35054 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cldn4O35054 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cldn4O35054 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cldn4O35054 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cldn4O35054 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cldn4O35054 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cldn4O35054 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Cldn4O35054 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cldn4O35054 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cldn4O35054 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cldn4O35054 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cldn4O35054 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cldn4O35054 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cldn4O35054 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cldn4O35054 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cldn4O35054 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cldn4O35054 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cldn4O35054 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cldn4O35054 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cldn4O35054 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cldn4O35054 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cldn4O35054 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cldn4O35054 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cldn4O35054 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Cldn4O35054 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cldn4O35054 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cldn4O35054 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cldn4O35054 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cldn4O35054 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cldn4O35054 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cldn4O35054 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Cldn4O35054 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cldn4O35054 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
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