Protein–RNA interactions for Protein: O09044

Snap23, Synaptosomal-associated protein 23, mousemouse

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snap23O09044 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
Snap23O09044 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
Snap23O09044 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Snap23O09044 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Snap23O09044 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Snap23O09044 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
Snap23O09044 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Snap23O09044 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Snap23O09044 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Snap23O09044 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Snap23O09044 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Snap23O09044 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Snap23O09044 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Snap23O09044 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Snap23O09044 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Snap23O09044 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Snap23O09044 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Snap23O09044 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Snap23O09044 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Snap23O09044 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Snap23O09044 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Snap23O09044 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Snap23O09044 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Snap23O09044 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Snap23O09044 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Snap23O09044 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Snap23O09044 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Snap23O09044 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Snap23O09044 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Snap23O09044 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Snap23O09044 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
Snap23O09044 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Snap23O09044 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Snap23O09044 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Snap23O09044 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Snap23O09044 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Snap23O09044 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Snap23O09044 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Snap23O09044 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Snap23O09044 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
Snap23O09044 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Snap23O09044 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Snap23O09044 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Snap23O09044 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Snap23O09044 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
Snap23O09044 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Snap23O09044 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Snap23O09044 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Snap23O09044 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Snap23O09044 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Snap23O09044 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Snap23O09044 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Snap23O09044 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Snap23O09044 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
Snap23O09044 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Snap23O09044 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
Snap23O09044 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Snap23O09044 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Snap23O09044 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Snap23O09044 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Snap23O09044 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Snap23O09044 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Snap23O09044 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Snap23O09044 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Snap23O09044 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Snap23O09044 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Snap23O09044 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
Snap23O09044 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Snap23O09044 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Snap23O09044 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Snap23O09044 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Snap23O09044 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Snap23O09044 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Snap23O09044 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
Snap23O09044 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Snap23O09044 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Snap23O09044 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Snap23O09044 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Snap23O09044 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Snap23O09044 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Snap23O09044 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Snap23O09044 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Snap23O09044 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Snap23O09044 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Snap23O09044 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Snap23O09044 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Snap23O09044 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Snap23O09044 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Snap23O09044 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Snap23O09044 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Snap23O09044 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Snap23O09044 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Snap23O09044 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Snap23O09044 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Snap23O09044 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Snap23O09044 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Snap23O09044 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Snap23O09044 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Snap23O09044 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Snap23O09044 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms