Protein–RNA interactions for Protein: L7MU04

H2al1o, Histone H2A, mousemouse

Predictions only

Length 110 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2al1oL7MU04 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
H2al1oL7MU04 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
H2al1oL7MU04 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
H2al1oL7MU04 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
H2al1oL7MU04 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
H2al1oL7MU04 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
H2al1oL7MU04 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
H2al1oL7MU04 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
H2al1oL7MU04 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
H2al1oL7MU04 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
H2al1oL7MU04 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
H2al1oL7MU04 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
H2al1oL7MU04 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
H2al1oL7MU04 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
H2al1oL7MU04 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
H2al1oL7MU04 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
H2al1oL7MU04 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
H2al1oL7MU04 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
H2al1oL7MU04 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
H2al1oL7MU04 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
H2al1oL7MU04 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
H2al1oL7MU04 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
H2al1oL7MU04 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
H2al1oL7MU04 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
H2al1oL7MU04 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
H2al1oL7MU04 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
H2al1oL7MU04 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
H2al1oL7MU04 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
H2al1oL7MU04 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
H2al1oL7MU04 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
H2al1oL7MU04 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
H2al1oL7MU04 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
H2al1oL7MU04 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
H2al1oL7MU04 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
H2al1oL7MU04 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
H2al1oL7MU04 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
H2al1oL7MU04 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
H2al1oL7MU04 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
H2al1oL7MU04 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
H2al1oL7MU04 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
H2al1oL7MU04 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
H2al1oL7MU04 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
H2al1oL7MU04 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
H2al1oL7MU04 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
H2al1oL7MU04 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
H2al1oL7MU04 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
H2al1oL7MU04 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
H2al1oL7MU04 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
H2al1oL7MU04 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
H2al1oL7MU04 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
H2al1oL7MU04 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
H2al1oL7MU04 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
H2al1oL7MU04 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
H2al1oL7MU04 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
H2al1oL7MU04 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
H2al1oL7MU04 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
H2al1oL7MU04 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
H2al1oL7MU04 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
H2al1oL7MU04 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
H2al1oL7MU04 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
H2al1oL7MU04 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
H2al1oL7MU04 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
H2al1oL7MU04 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
H2al1oL7MU04 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
H2al1oL7MU04 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
H2al1oL7MU04 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
H2al1oL7MU04 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
H2al1oL7MU04 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
H2al1oL7MU04 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
H2al1oL7MU04 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
H2al1oL7MU04 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
H2al1oL7MU04 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
H2al1oL7MU04 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
H2al1oL7MU04 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
H2al1oL7MU04 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
H2al1oL7MU04 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
H2al1oL7MU04 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
H2al1oL7MU04 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
H2al1oL7MU04 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
H2al1oL7MU04 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
H2al1oL7MU04 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
H2al1oL7MU04 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
H2al1oL7MU04 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
H2al1oL7MU04 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
H2al1oL7MU04 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
H2al1oL7MU04 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
H2al1oL7MU04 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
H2al1oL7MU04 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
H2al1oL7MU04 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
H2al1oL7MU04 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
H2al1oL7MU04 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
H2al1oL7MU04 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
H2al1oL7MU04 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
H2al1oL7MU04 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
H2al1oL7MU04 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
H2al1oL7MU04 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
H2al1oL7MU04 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
H2al1oL7MU04 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
H2al1oL7MU04 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
H2al1oL7MU04 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms