Protein–RNA interactions for Protein: K9J7F4

Gm8720, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8720K9J7F4 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm8720K9J7F4 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm8720K9J7F4 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm8720K9J7F4 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm8720K9J7F4 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm8720K9J7F4 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm8720K9J7F4 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm8720K9J7F4 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm8720K9J7F4 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm8720K9J7F4 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm8720K9J7F4 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Gm8720K9J7F4 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Gm8720K9J7F4 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm8720K9J7F4 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm8720K9J7F4 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm8720K9J7F4 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm8720K9J7F4 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm8720K9J7F4 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm8720K9J7F4 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm8720K9J7F4 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm8720K9J7F4 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm8720K9J7F4 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm8720K9J7F4 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm8720K9J7F4 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm8720K9J7F4 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm8720K9J7F4 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm8720K9J7F4 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm8720K9J7F4 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm8720K9J7F4 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm8720K9J7F4 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm8720K9J7F4 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm8720K9J7F4 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm8720K9J7F4 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm8720K9J7F4 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm8720K9J7F4 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm8720K9J7F4 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm8720K9J7F4 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm8720K9J7F4 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm8720K9J7F4 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm8720K9J7F4 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm8720K9J7F4 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm8720K9J7F4 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm8720K9J7F4 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm8720K9J7F4 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm8720K9J7F4 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm8720K9J7F4 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm8720K9J7F4 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm8720K9J7F4 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm8720K9J7F4 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm8720K9J7F4 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm8720K9J7F4 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm8720K9J7F4 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm8720K9J7F4 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm8720K9J7F4 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm8720K9J7F4 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm8720K9J7F4 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm8720K9J7F4 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm8720K9J7F4 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm8720K9J7F4 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm8720K9J7F4 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm8720K9J7F4 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm8720K9J7F4 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm8720K9J7F4 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm8720K9J7F4 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm8720K9J7F4 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm8720K9J7F4 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm8720K9J7F4 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm8720K9J7F4 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm8720K9J7F4 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm8720K9J7F4 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm8720K9J7F4 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm8720K9J7F4 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm8720K9J7F4 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm8720K9J7F4 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm8720K9J7F4 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm8720K9J7F4 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm8720K9J7F4 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm8720K9J7F4 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm8720K9J7F4 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm8720K9J7F4 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm8720K9J7F4 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm8720K9J7F4 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm8720K9J7F4 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm8720K9J7F4 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm8720K9J7F4 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm8720K9J7F4 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm8720K9J7F4 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm8720K9J7F4 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm8720K9J7F4 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm8720K9J7F4 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm8720K9J7F4 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm8720K9J7F4 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm8720K9J7F4 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm8720K9J7F4 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm8720K9J7F4 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm8720K9J7F4 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm8720K9J7F4 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm8720K9J7F4 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm8720K9J7F4 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm8720K9J7F4 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms