Protein–RNA interactions for Protein: J3QPI0

Gm8298, Predicted gene 8298, mousemouse

Predictions only

Length 401 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8298J3QPI0 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gm8298J3QPI0 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gm8298J3QPI0 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gm8298J3QPI0 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gm8298J3QPI0 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Gm8298J3QPI0 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Gm8298J3QPI0 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gm8298J3QPI0 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Gm8298J3QPI0 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Gm8298J3QPI0 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gm8298J3QPI0 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gm8298J3QPI0 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gm8298J3QPI0 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gm8298J3QPI0 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gm8298J3QPI0 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Gm8298J3QPI0 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
Gm8298J3QPI0 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Gm8298J3QPI0 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Gm8298J3QPI0 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Gm8298J3QPI0 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Gm8298J3QPI0 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Gm8298J3QPI0 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gm8298J3QPI0 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gm8298J3QPI0 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gm8298J3QPI0 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gm8298J3QPI0 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gm8298J3QPI0 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gm8298J3QPI0 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gm8298J3QPI0 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gm8298J3QPI0 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gm8298J3QPI0 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gm8298J3QPI0 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gm8298J3QPI0 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gm8298J3QPI0 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Gm8298J3QPI0 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gm8298J3QPI0 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Gm8298J3QPI0 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gm8298J3QPI0 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gm8298J3QPI0 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gm8298J3QPI0 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gm8298J3QPI0 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gm8298J3QPI0 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gm8298J3QPI0 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gm8298J3QPI0 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gm8298J3QPI0 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gm8298J3QPI0 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gm8298J3QPI0 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gm8298J3QPI0 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gm8298J3QPI0 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gm8298J3QPI0 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gm8298J3QPI0 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gm8298J3QPI0 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gm8298J3QPI0 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gm8298J3QPI0 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gm8298J3QPI0 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gm8298J3QPI0 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gm8298J3QPI0 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gm8298J3QPI0 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gm8298J3QPI0 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gm8298J3QPI0 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gm8298J3QPI0 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gm8298J3QPI0 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gm8298J3QPI0 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Gm8298J3QPI0 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Gm8298J3QPI0 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Gm8298J3QPI0 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Gm8298J3QPI0 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Gm8298J3QPI0 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Gm8298J3QPI0 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Gm8298J3QPI0 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gm8298J3QPI0 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gm8298J3QPI0 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gm8298J3QPI0 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gm8298J3QPI0 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gm8298J3QPI0 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gm8298J3QPI0 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gm8298J3QPI0 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gm8298J3QPI0 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gm8298J3QPI0 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gm8298J3QPI0 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gm8298J3QPI0 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gm8298J3QPI0 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gm8298J3QPI0 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gm8298J3QPI0 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Gm8298J3QPI0 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gm8298J3QPI0 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gm8298J3QPI0 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gm8298J3QPI0 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Gm8298J3QPI0 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Gm8298J3QPI0 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Gm8298J3QPI0 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Gm8298J3QPI0 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Gm8298J3QPI0 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Gm8298J3QPI0 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Gm8298J3QPI0 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Gm8298J3QPI0 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Gm8298J3QPI0 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gm8298J3QPI0 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gm8298J3QPI0 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gm8298J3QPI0 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.8 ms