Protein–RNA interactions for Protein: J3QP87

Gm2035, Predicted pseudogene 2035, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2035J3QP87 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Gm2035J3QP87 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Gm2035J3QP87 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Gm2035J3QP87 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Gm2035J3QP87 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Gm2035J3QP87 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Gm2035J3QP87 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Gm2035J3QP87 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Gm2035J3QP87 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Gm2035J3QP87 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Gm2035J3QP87 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Gm2035J3QP87 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Gm2035J3QP87 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Gm2035J3QP87 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Gm2035J3QP87 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Gm2035J3QP87 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Gm2035J3QP87 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Gm2035J3QP87 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Gm2035J3QP87 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Gm2035J3QP87 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Gm2035J3QP87 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Gm2035J3QP87 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Gm2035J3QP87 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Gm2035J3QP87 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Gm2035J3QP87 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Gm2035J3QP87 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Gm2035J3QP87 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Gm2035J3QP87 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Gm2035J3QP87 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Gm2035J3QP87 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Gm2035J3QP87 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Gm2035J3QP87 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Gm2035J3QP87 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Gm2035J3QP87 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
Gm2035J3QP87 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Gm2035J3QP87 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Gm2035J3QP87 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Gm2035J3QP87 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Gm2035J3QP87 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Gm2035J3QP87 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Gm2035J3QP87 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Gm2035J3QP87 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Gm2035J3QP87 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Gm2035J3QP87 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Gm2035J3QP87 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Gm2035J3QP87 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Gm2035J3QP87 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Gm2035J3QP87 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Gm2035J3QP87 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Gm2035J3QP87 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Gm2035J3QP87 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Gm2035J3QP87 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Gm2035J3QP87 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Gm2035J3QP87 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Gm2035J3QP87 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Gm2035J3QP87 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Gm2035J3QP87 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Gm2035J3QP87 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
Gm2035J3QP87 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Gm2035J3QP87 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Gm2035J3QP87 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Gm2035J3QP87 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Gm2035J3QP87 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Gm2035J3QP87 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Gm2035J3QP87 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Gm2035J3QP87 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Gm2035J3QP87 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Gm2035J3QP87 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Gm2035J3QP87 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Gm2035J3QP87 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Gm2035J3QP87 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Gm2035J3QP87 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Gm2035J3QP87 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Gm2035J3QP87 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Gm2035J3QP87 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Gm2035J3QP87 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Gm2035J3QP87 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Gm2035J3QP87 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Gm2035J3QP87 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Gm2035J3QP87 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Gm2035J3QP87 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Gm2035J3QP87 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Gm2035J3QP87 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Gm2035J3QP87 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Gm2035J3QP87 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Gm2035J3QP87 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Gm2035J3QP87 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Gm2035J3QP87 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Gm2035J3QP87 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Gm2035J3QP87 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Gm2035J3QP87 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Gm2035J3QP87 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Gm2035J3QP87 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Gm2035J3QP87 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gm2035J3QP87 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gm2035J3QP87 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gm2035J3QP87 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gm2035J3QP87 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gm2035J3QP87 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gm2035J3QP87 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
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